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蛋白之家

新虫 (小有名气)

[求助] 关于酶切表达载体的问题

各位大侠:
    表达载体是4547碱基,其上的两个酶切位点之间相差40个碱基,本来是应该切掉这40个碱基,,可是每次切都有1000处有一条带  然后还有一个4000多的条带
载体是老板给的   图谱是从一篇文献上找的 根据图谱设计的酶切位点   能不能大家帮忙分析一下原因
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woshizhufeng

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
文献上的没切位点是不是不全啊,你在仔细找找其他的文章,看有没有其他的酶切位点。
2楼2012-08-15 08:42:16
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sl35537417

木虫 (正式写手)

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-08-15 15:31:34
1.载体本身不对  或者 图谱不对
2.酶有问题 或者酶切反应体系有问题 导致星号活性
3.有可能你得到的载体不是空载体  有可能连有别的片段
3楼2012-08-15 09:12:41
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sky_fly

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

可以根据质粒序列设计多个引物,进行测序,看看序列对不对,不过很多时候可能都是酶切时间太长造成的错切
绝望越大,突破就越大
4楼2012-08-21 10:38:34
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huangguoqing

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-08-21 16:21:07
个人建议:
1.确定你选择的酶切位点是单克隆位点;
2.双酶切的时候buffer要选择好,而且要知道酶有没有星活性;
3.确定载体是空载体。
5楼2012-08-21 12:03:56
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蛋白之家

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by sky_fly at 2012-08-21 10:38:34
可以根据质粒序列设计多个引物,进行测序,看看序列对不对,不过很多时候可能都是酶切时间太长造成的错切

只切一个小时也是同样的效果么关键是
6楼2012-09-05 09:25:23
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huguangdong

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
小丹木木: 金币+3, 应助指数+1, 鼓励积极交流经验 2012-09-05 14:00:10
大阪市由于该载体资料不全,导致你对载体酶切位点分析有误造成的,你所用的酶切位点在载体上应该有两个,建议这样:
1 在谷歌上输入该载体的全名,后面一个空格输入sequence一般都能查到商品化载体序列,然后用DNAMAN或者BIOXM等分子生物学软件分析酶切位点,全面检查一下是否有重复的酶切位点。
2 考虑内切酶的污染和质量,如果你们实验室的内切酶是公用的,就要考虑是否别人在做双酶切的时候污染了其他内切酶,导致酶切条带有误,另外内切酶牌子的选择也是有讲究的,NEB的一般保真性和效率最好,性活性概率最低甚至没有,MBI和TAKARA的就要选择好BUFFER,否则时间长会有星活性,但是就你的实验来看,星活性概率不大,毕竟酶切时间很短。
一般你这种情况就是上述两种可能,一一排除吧。
7楼2012-09-05 11:06:28
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蛋白之家

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by huguangdong at 2012-09-05 11:06:28
大阪市由于该载体资料不全,导致你对载体酶切位点分析有误造成的,你所用的酶切位点在载体上应该有两个,建议这样:
1 在谷歌上输入该载体的全名,后面一个空格输入sequence一般都能查到商品化载体序列,然后用DNA ...

嗯  很感谢
8楼2012-09-05 16:22:27
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