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zxd95

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 基因组PCR的问题 已有3人参与

最近,想扩增红皮梨WD40基因的启动子;现在已知WD40的cDNA序列,设计特异性引物SP3;已知砀山梨(非红皮梨)WD40的基因组序列,在砀山梨WD40基因ATG上游1300 bp处设计特异性引物WD40-F;现在以红皮梨基因组为模板,使用SP3和WD40-F进行PCR扩增,W泳道获得一大一小两个条带;作者认为量太少,就进行分别切胶、液氮冷冻、离心,获得溶胶液100 ul;分别以这两种溶胶液为模板(50 ul体系取4 ul和2 ul)进行PCR扩增,结果如后一个图,条带模糊。这是怎么回事?是不是需要重新以基因组为模板进行PCR扩增,连T后测序?

以红皮梨基因组为模板,使用SP3和WD40-F进行PCR扩增的结果



WD40-L和WD40-S分别为以上图W泳道的大片段和小片段为模板,SP3和WD40-F进行PCR扩增的结果
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追梦的人
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wu_shiyong

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
LZ  是想做测序吗?PCR产物和引物直接送公司测序就行,不用再连载体!你的PCR产物亮度足够测序啦!
低调稳重务实内敛---------------残
3楼2012-08-02 13:36:15
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zhcosa

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主觉得下面的图模糊吗,为毛我觉得挺好哇?可以连接切胶连接转化送测序了吧。。。。

话说上面那个图的量也不少哇,够用了吧
2楼2012-08-02 13:23:30
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ghs25372216

禁虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-08-03 13:42:28
本帖内容被屏蔽

4楼2012-08-02 16:45:07
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