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lovestrings金虫 (小有名气)
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[求助]
引物设计，新手求助
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| 现在想设计一段引物，因为是新手，只知道用primer软件，但是不知道应该做哪些准备，比方说需不需要基因的序列，还有引物设计的流程也不清楚，请大师们指点一下，主要是帮我扫个盲~~ |
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zhleiD
铜虫 (初入文坛)
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- 专业: 微生物资源与分类学
3楼2012-07-30 11:17:16
robert-RBT
木虫 (小有名气)
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lovestrings: 金币+5, ★★★很有帮助, 非常感谢~~ 2012-07-29 09:02:38
感谢参与，应助指数 +1
lovestrings: 金币+5, ★★★很有帮助, 非常感谢~~ 2012-07-29 09:02:38
| 取决于你已知信息和所要扩增的片段。如果只是知道蛋白质序列，没有DNA序列，那就需要设计简并引物，需要知道所研究物种的密码子的偏好性，选择简并密码子较少的氨基酸等等；如果知道DNA序列，为了通过扩增得到片段，那就比较简单，可以用NCBI上的primer select进行，只需要把序列输入进去，把对引物的要求（比如扩增长度和位置等），搜索即可得到很多条引物。选择的时候，一般避开3‘端是A，这样引发PCR反应的效率较低。网上有很多相关信息。 |
2楼2012-07-28 21:32:01