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waldenpond

金虫 (著名写手)

[求助] DGGE不同的样本却同样的条带

最近做DGGE,做了两三批样本。每次做,同批样本总是跑出同样的条带(一模一样)。根据我收集的资料,这几个样本的条带应该是有不同的(出现特异性条带)。下面是我的图片,大家看一下,什么原因会导致这种情况啊?
10、18、64、66是样本号,B1……B6是条带编码,其中几个暗的条带我没有编码,但4个样本都是一样的。(DGGE空白对照组(也就是以dd水为模板的PCR产物跑DGGE)未出现任何条带。)
我初步的分析是:1.污染(但我真怀疑每次污染都一模一样,太巧了)
2.可能每个条带代表多种细菌,将条带回收测序结果可能包含自己想要的特异性细菌。
大家怎么认为,帮我分析一下原因吧。多谢!

(这是最近一次DGGE)

(之前一次DGGE:条带基本一样,但样本是不一样的)

[ Last edited by waldenpond on 2012-7-16 at 14:04 ]
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