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waldenpond金虫 (著名写手)
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DGGE不同的样本却同样的条带
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最近做DGGE，做了两三批样本。每次做，同批样本总是跑出同样的条带（一模一样）。根据我收集的资料，这几个样本的条带应该是有不同的（出现特异性条带）。下面是我的图片，大家看一下，什么原因会导致这种情况啊？ 10、18、64、66是样本号，B1……B6是条带编码，其中几个暗的条带我没有编码，但4个样本都是一样的。（DGGE空白对照组（也就是以dd水为模板的PCR产物跑DGGE）未出现任何条带。） 我初步的分析是：1.污染（但我真怀疑每次污染都一模一样，太巧了） 2.可能每个条带代表多种细菌，将条带回收测序结果可能包含自己想要的特异性细菌。 大家怎么认为，帮我分析一下原因吧。多谢！  （这是最近一次DGGE）  （之前一次DGGE：条带基本一样，但样本是不一样的） [ Last edited by waldenpond on 2012-7-16 at 14:04 ] |
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wubingqi
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