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war3one

金虫 (著名写手)

[求助] 构建质粒的问题

我现在有个整合载体,有一个质粒,我想把整合载体里边的一个基因替换成质粒里边的营养缺陷性基因,请问试验如何设计?
谢谢各位的帮助了
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【分子生物】EPI帖 核酸与基因生物学

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tianyinghu

金虫 (小有名气)

突变2个酶切位点也太简单了吧,你直接把载体中要取代的基因换成2个酶切位点就好了,但也要提醒你一点,中间最好有间隔序列,因为有的酶是有庞端设别序列的,然后F的引物3端和载体正向完全结合就好了,同样的R端引物也同理。
3楼2012-07-09 10:09:54
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tianyinghu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, MolEPI+1, 鼓励积极解决问题 2012-07-04 13:53:01
war3one: 金币+15, ★★★★★最佳答案, 谢谢,但是请问下如何突变成2个酶切位点呢? 2012-07-05 10:24:16
方法很多:
    介绍一种比较方便的方法吧,我目前就把你这2个基因编个号吧:
整合载体里边的一个基因:A,营养缺陷性基因:B
  估计A基因2端没有酶切位点才犯愁的,如果有酶切位点的话那就简单多了,直接把B基因PCR酶切连接就好了,那怕这酶切位点不是直接跟在A的都好办的,只有把多余的序列设计到引物上就好了,当然比较头疼的是A的2端没有酶切位点。遇到这种情况也分2种比较常用的方法,如果你手里有Infusion酶的话,那就好办多了,设计2对引物,直接把整合载体P出来,接头设计20个只有的B基因,同样的B基因的引物加整合载体接头序列,如果你没有这个酶的话,你可以设计2个酶切位点,把这个A基因给突变掉,突变成2个酶切位点就可以了,然后正常的PCR酶切连接。
2楼2012-07-04 12:26:08
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