| 查看: 1459 | 回复: 2 | |||
bbslover金虫 (正式写手)
|
[求助]
小分子药物与靶标蛋白对接后-进行MD模拟-一般对配体和受体使用什么力场？
|
|
小分子药物与靶标蛋白对接后-进行MD模拟-一般对配体和受体使用什么力场？ 比如说：用amber进行MD研究。 对蛋白使用AMBER FF03 力场 and 对配体使用GAFF 力场。 那如果使用gromacs，对蛋白和配体分别使用什么力场呢？ 那如果使用NAMD，对蛋白和配体分别使用什么力场呢？ 谢谢大家帮助！ |
回复此楼» 猜你喜欢
材料与化工371求调剂
已经有5人回复
-
328分调剂
已经有4人回复
-
295求调剂
已经有7人回复
-
081700，311，求调剂
已经有13人回复
-
283分求调剂
已经有6人回复
-
0854求调剂
已经有3人回复
-
332求调剂
已经有4人回复
-
284求调剂
已经有5人回复
-
304求调剂（085602，过四级，一志愿985）
已经有11人回复
-
0817化学工程与技术求调剂，一志愿中海洋319
已经有10人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- RNA条带总是有杂带
已经有5人回复
- 烟密度测试
已经有19人回复
- 简并引物需要加保护碱基吗
已经有7人回复
- 请教各位大牛，SYBYL-X中，SURFLEX-DOCK可加两个配体吗？可加水箱进行对接吗？
已经有7人回复
- 用autodock做对接，box设置无法包括受体活性区域和配体
已经有6人回复
- 求助：蛋白质对接 分子动力学
已经有10人回复
- 蛋白分子建模 小分子化合物画图 酶与配体的分子模拟
已经有11人回复
- Autodock只能进行受体与配体1:1的对接吗 急急急
已经有4人回复
- 适配体aptamer与蛋白结合以及与互补链结合作用力哪个比较大呢？
已经有14人回复
- 配体与打分分子不能很好对接，怎么回事？
已经有8人回复
- 分子对接前配体是怎么处理的啊-例如用AD做
已经有14人回复
- 做分子对接前选择配体和受体时有什么要求吗？
已经有5人回复
caixin5120 
木虫 (正式写手)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 46 (小学生)
- 金币: 5.9
- 散金: 100
- 红花: 3
- 帖子: 483
- 在线: 158.3小时
- 虫号: 576460
- 注册: 2008-06-20
- 专业: 药物化学
2楼2012-06-20 09:46:32
3楼2012-06-20 23:12:36
