应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 关于系统发育树，真搞不懂了
51/1返回列表
查看: 1030  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

分子结构

金虫 (小有名气)

[求助] 关于系统发育树，真搞不懂了

这是我建立的系统发育树，标尺是0.05.如图所示，其中HL（目的菌株）与GE和PS是最接近的，就图所示，HL与GE、PS哪一个更接近一些？（GE和PS是平行的。）
      补充：GE和PS一个是有性型一个是无性型，所以直接影响我菌株的判断，按照形态结构来说，我的目的菌株应该是GE，但是建立的系统发育树是这样的。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
永远不要为失去的感到遗憾——你没有摘到的，只是春天的一朵花，整个春天还是你的。
1楼 2012-06-13 16:36:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

含笑天天

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以先通过blast确定你这个菌株的种，做树的话在核糖体数据库里面选择代表性菌株的16S，不要在ncbi上选择那些非代表性菌株，代表性菌株选择好做树，根据可信度来调整做树序列。
赞一下 回复此楼
虫虫虫虫
3楼2012-06-14 10:17:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你先不要把Ge加进去，只有ps和其他的，进行clustalX同源性分析，然后Mega，看看HL与ps的同源可行度，然后再用ge与其他的根HL比，看看其可信度。这个数字只表示可信度，现在只能看出HL与GE和ps的上一级祖先的可信度为86%，ps和Ge的同源可行度为76%，因此只要随便去掉一个，HL与ps或者hl与ge的关系就一目了然了。
赞一下 回复此楼
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
2楼2012-06-14 09:49:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭