24小时热门版块排行榜    

查看: 1050  |  回复: 2

分子结构

金虫 (小有名气)

[求助] 关于系统发育树,真搞不懂了

这是我建立的系统发育树,标尺是0.05.如图所示,其中HL(目的菌株)与GE和PS是最接近的,就图所示,HL与GE、PS哪一个更接近一些?(GE和PS是平行的。)
      补充:GE和PS一个是有性型一个是无性型,所以直接影响我菌株的判断,按照形态结构来说,我的目的菌株应该是GE,但是建立的系统发育树是这样的。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

永远不要为失去的感到遗憾——你没有摘到的,只是春天的一朵花,整个春天还是你的。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你先不要把Ge加进去,只有ps和其他的,进行clustalX同源性分析,然后Mega,看看HL与ps的同源可行度,然后再用ge与其他的根HL比,看看其可信度。这个数字只表示可信度,现在只能看出HL与GE和ps的上一级祖先的可信度为86%,ps和Ge的同源可行度为76%,因此只要随便去掉一个,HL与ps或者hl与ge的关系就一目了然了。
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
2楼2012-06-14 09:49:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

含笑天天

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以先通过blast确定你这个菌株的种,做树的话在核糖体数据库里面选择代表性菌株的16S,不要在ncbi上选择那些非代表性菌株,代表性菌株选择好做树,根据可信度来调整做树序列。
虫虫虫虫
3楼2012-06-14 10:17:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 分子结构 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 329求调剂 +5 1() 2026-03-22 5/250 2026-03-26 20:40 by fmesaito
[考研] 329求调剂 +11 想上学吖吖 2026-03-19 11/550 2026-03-26 20:30 by 不吃魚的貓
[考研] 071000生物学求调剂,初试成绩343 +4 小小甜面团 2026-03-25 4/200 2026-03-26 20:26 by wxywyq
[考研] 材料调剂 +7 匹克i 2026-03-23 7/350 2026-03-26 19:00 by 不吃魚的貓
[考研] 中国科学院深圳先进技术研究院-光纤传感课题组招生-中国科学院大学、深圳理工大学联培 +5 YangTyu1 2026-03-26 5/250 2026-03-26 18:27 by 猫咪猫咪呀
[考研] 352求调剂 +4 大米饭! 2026-03-22 4/200 2026-03-26 16:40 by 不吃魚的貓
[考研] 085602 289分求调剂 +8 WWW西西弗斯 2026-03-24 8/400 2026-03-26 16:33 by 不吃魚的貓
[考研] 资源与环境 调剂申请(333分) +9 holy J 2026-03-21 9/450 2026-03-26 15:47 by 161765490
[考研] 0856求调剂 +8 zhn03 2026-03-25 9/450 2026-03-26 13:42 by zzll406
[考研] 寻找调剂 +5 倔强芒? 2026-03-21 8/400 2026-03-26 13:25 by 0906ljy
[考研] 296求调剂 +5 www_q 2026-03-20 5/250 2026-03-26 12:56 by 3Strings
[考研] 334分 一志愿武理-080500 材料求调剂 +4 李李不服输 2026-03-25 4/200 2026-03-25 21:26 by 星空星月
[考研] 289求调剂 +9 怀瑾握瑜l 2026-03-20 9/450 2026-03-25 11:02 by userper
[考研] 318求调剂 +5 plum李子 2026-03-21 8/400 2026-03-25 09:26 by aa331100
[考研] 一志愿吉大化学322求调剂 +4 17501029541 2026-03-23 6/300 2026-03-24 10:21 by 戴围脖的小蚊子
[考研] 335求调剂 +4 yuyu宇 2026-03-23 5/250 2026-03-23 23:49 by Txy@872106
[考研] 求调剂 +5 Zhangbod 2026-03-21 7/350 2026-03-22 13:13 by Zhangbod
[考研] 考研调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-21 3/150 2026-03-21 20:04 by 无际的草原
[考研] 295材料求调剂,一志愿武汉理工085601专硕 +5 Charlieyq 2026-03-19 5/250 2026-03-20 20:35 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西安交通大学 学硕 354求调剂211或者双一流 +3 我想要读研究生 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:13 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见