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rainbow8

新虫 (小有名气)

[求助] 关于PCR整个质粒的问题

各位虫友好,我的问题概括起来说就是:我需要从一个8k的质粒上p大约7k的片段,就是只有1k的片段我不要。质粒是环形的,不线性化。请问我p出来的条带跑电泳看怎么都是8k的,不会把整个质粒都p出来了吧。我的引物不包括我不要那一部分的序列啊。
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学海无涯,回头是岸
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莹莹陀zws

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
那就是你没有扩出来,很常见的失败现象
悲伤着你的悲伤,幸福着你的幸福
2楼2012-06-01 16:48:31
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liuyu_sdili

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个电泳有时候不好说,做胶做不好也会有各个泳道迁移率一样的情况,重新跑电泳看看,如果你知道质粒序列的话可以正反向测序各测一个反应,看看是不是你想要的那部分~~~~~
如果楼主真是知道质粒的序列,那应该问题不大~~~~
3楼2012-06-01 17:10:41
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starseacow

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
不知道楼主是否有特殊需要必须经过PCR扩增质粒片段。为了避免扩增整个质粒,也可以找合适位点对质粒酶切,跑胶,把7kb那部分切胶回收,作为模板PCR。
植物生理群69993869,为避免广告,申请加入请提供木虫昵称,院校及专业信息
4楼2012-06-01 22:52:47
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
嗯...................
        据我实验中的结果,凡是在7K以上的迁移率几乎都是有很微小的差别的 除非你的胶足够软(低于0.7%)且两条带差据2kb以上 电泳实验还要足够长些 才能有肉眼看到差别的
       别太在意迁移率 如果量足够大 回收了做个酶切也可以鉴定哦
       个人看法 若有说错请高手指点
Let God do with it as He wills
5楼2012-06-01 23:58:11
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

OMG 自己打出一堆错别字.........................真是实验做晕了
Let God do with it as He wills
6楼2012-06-02 00:00:33
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435632866

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
跑电泳时可以把质粒也点上作对照,应该就能看的清楚些。
7楼2012-06-03 06:45:38
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0624410024

金虫 (正式写手)

Begging for knowledge

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
看看你的序列中有没有酶切位点,有的话我酶切下看看,然后分析下!
每天坚持多一点,以后困难少一点!
8楼2012-06-03 11:02:30
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