24小时热门版块排行榜    

查看: 2468  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhannanxia

银虫 (小有名气)

[求助] 已经克隆测序到了matK序列,如何界定?急切求助中,谢谢!

大侠们好,我这边有两个问题帮忙解疑下:
1.我已经通过克隆测序,获得了20几个不同样品的matK序列,大小在700多bp,而NCBI上比对的matK序列有的达到1500bp左右(全基因序列),请问现在要怎么人工剪辑?就是如何确定我克隆到的基因序列长度,用来序列差异分析和构建系统发育树。
2.同上,基因序列长度如何确定,用于genebank的提交?
3.比如苹果“红富士”,这个品种之前有人已经在NCBI上提交过matK的核苷酸序列,我现在重新测序的和前人略有不同,还可以申请提交吗?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

的卢

新虫 (初入文坛)

好吧,表示看看这个。。。
亲,小弟弟来了,多要多照呼哦。。。
6楼2012-06-04 00:51:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

zhannanxia

银虫 (小有名气)

不知道描述详尽不,
自己再顶一下,
2楼2012-06-01 16:40:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linyanfei

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhaohq1209: 金币+2, 有道理~ 2012-06-02 10:31:01
zhannanxia: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-06-04 10:48:07
你的matK是什么基因呀?你用你的上下游引物比对了后,剪切掉载体上的序列,剩下的就是你的目的序列了!还有,如果你的cDNA序列只是同别人的序列只差几个碱基的话那你就要慎重了,有可能是碱基错配造成的,最好是比对一下氨基酸序列!如果氨基酸序列不一样的话,还可以考虑,如果氨基酸序列完全一样的话那就没有必要了!
3楼2012-06-01 21:30:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhaohq1209: 金币+2, 有帮助~只选取已有的序列做比对 2012-06-02 10:31:25
zhannanxia: 金币+2, 有帮助 2012-06-04 10:47:30
如要建系统发育树,那你需要截取NCBI上相关序列的相应区域,然后再作比对建树。可以先把你的序列和NCBI的一起做个多序列比对,然后根据结果截取各序列的相应片段,再重新做多序列比对建树。
4楼2012-06-02 00:45:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +5 zju2000 2026-08-16 5/250 2026-08-16 23:23 by Haru815
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +32 医学老男孩 2026-08-13 74/3700 2026-08-16 21:05 by 医学老男孩
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] filecode +8 cratir 2026-08-14 12/600 2026-08-15 18:08 by zyfgau
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +12 Tide man 2026-08-10 13/650 2026-08-15 16:34 by 氺木
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
信息提示
请填处理意见