24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2816  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xiazhiwuxie

银虫 (小有名气)


[交流] 关于启动子预测

克隆启动子,得到一个2000多bp的片段,用不同的启动子预测软件预测的结果不一样
用PLACE预测,得到了一堆ABRERATCAL,ACGTATERD1,ANAERO2CONSENSUS, ASF1MOTIFCAMV,CAATBOX1 ,CACGTGMOTIF,CACTFTPPCA1,CGCGBOXAT等,但不知道怎么分析

用BDGP预测(利用神经网络算法预测真核及原核生物启动子)
结果如下:
Promoter predictions for 1 eukaryotic sequence with score cutoff 0.80 (transcription start shown in larger font):


然后用其他的软件就预测不到,比方说PROMOTER 2.0, Web Promoter Scan Service


这以上的结果说明了什么呢?请各位大侠明示。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wh672

金虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
同样在做预测,看不懂。。
8楼2018-11-30 16:05:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

xiazhiwuxie

银虫 (小有名气)


下面的那幅图是用BDGP预测的
2楼2012-05-02 08:46:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

angie8610

铁虫 (小有名气)


★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西瓜: 金币+1, 鼓励交流 2012-05-08 18:56:23
综合各个软件的分析结果再根据启动子核心区域的一些特征,比如CpG岛TATAbox等等确定,这个确实是一个很复杂的工作。。。
3楼2012-05-02 08:59:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Diacetyl

铁虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我把目的基因的启动子上游、至上一个基因的所有序列都扒下来了
4楼2012-05-02 11:09:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 285求调剂 +7 AZMK 2026-04-05 12/600 2026-04-07 00:18 by AZMK
[考研] 一志愿吉大化学327求调剂 +6 王王白石 2026-04-06 7/350 2026-04-06 21:46 by dongzh2009
[考研] 327求调剂 +5 Xxjc1107. 2026-04-06 5/250 2026-04-06 21:43 by dongzh2009
[考研] 328求调剂 +3 ghhh88888 2026-04-06 3/150 2026-04-06 21:35 by 啵啵啵0119
[考研] 材料与化工363求推荐 +11 zh096 2026-04-04 11/550 2026-04-06 19:14 by guanxin1001
[考研] 318求调剂 +12 ykyhsa 2026-04-05 14/700 2026-04-06 17:46 by fuyu_
[考研] 372分,材料与化工,一志愿湖南大学,求调剂 +3 蓝笺片 2026-04-01 3/150 2026-04-06 09:04 by 无际的草原
[考研] 一志愿C9的化学工程(085602) 340分,感觉校内调剂无望,求调剂 +12 万事宜臻 2026-04-04 12/600 2026-04-06 07:46 by 无际的草原
[考研] 331求调剂 +8 于征yz 2026-04-05 8/400 2026-04-06 00:54 by fmesaito
[考研] 材料调剂 +14 壹贰贰亿 2026-04-04 14/700 2026-04-05 23:31 by 来看流星雨10
[考研] 326求调剂 +3 顾若浮生 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:32 by 蓝云思雨
[考研] 336求调剂 +8 kiyy 2026-04-01 8/400 2026-04-03 19:41 by lijunpoly
[考研] 372分材料与化工(085600)一志愿湖南大学求调剂 +3 蓝笺片 2026-04-03 4/200 2026-04-03 17:58 by Jimmyandyou
[考研] 274求调剂 +9 顺理成张 2026-04-03 10/500 2026-04-03 15:10 by 啊俊!
[考研] 土木水利328分求调剂 +6 疾风知劲草666 2026-04-02 6/300 2026-04-03 11:38 by znian
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +6 崔wj 2026-04-02 6/300 2026-04-03 10:19 by 蓝云思雨
[考研] 专硕 351 086100 也是考的材科基 本科也是材料 +8 202451007219 2026-04-02 8/400 2026-04-03 09:50 by 蓝云思雨
[考研] 372分材料与化工(085600)一志愿湖南大学求调剂 +5 蓝笺片 2026-04-02 6/300 2026-04-02 21:37 by dongzh2009
[考研] 能源动力 调剂 +3 不破不立0 2026-04-02 3/150 2026-04-02 12:46 by ffffjjjj
[考研] 085600,321分求调剂 +13 大馋小子 2026-03-31 13/650 2026-04-01 12:35 by chemdavid
信息提示
请填处理意见