24小时热门版块排行榜    

查看: 1857  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

alicelchf

木虫 (著名写手)

[求助] 奇怪的PCR产物

构建的上下游引物分别携带了PsgI(NcoI同尾酶)、XhoI位点,得到目的片段产物,然后将其回收、双酶切消化、80度灭火;
载体经过NcoI、XhoI双酶切,电泳切胶回收。
按照不同片段和载体比例进行连接ligase,转化得到质粒(6700bp左右)
问题在于(1)我们的质粒无论是试剂盒、手提得到的浓度都很少,而且是两条带(附件一20120418 pet28-10);转化至plate有菌落,但是经过再一次双酶切之后电泳完全看不到任何片段或是载体。是我们根本没连接上吗?
(2)我们以克隆的新载体作为模板进行PCR,得到的居然更多条带(附件二20120419 pm pcr 亚克隆),初步觉得是因为引物特异性比较差,因为引物较长而且有些比较特殊的要求导致无法简短、增加特异性;所以我都怀疑我们一直以来PCR出来的事原来模板的非目的片段。所以很想知道出现这么多条带的原因有可能是什么?
顺带说一句,我们摇出来菌浑浊了,送去检测 nothing
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 20120418 pet28-10.jpg
  • 2012-04-19 22:02:30, 9.76 K
  • 附件 2 : 20120419 pcr 亚克隆.tif
  • 2012-04-19 22:02:36, 1.25 M

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

修身、齐家、治国、平天下
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alicelchf

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sunwei57 at 2012-04-19 22:46:18:
你用什么酶做的酶切,同位酶连接后原来的酶是切不开的,质粒稀释100-1000再做PCR

NcoI(Psg I),fermantas
XhoI, TAKARA

我知道切不开,所以没办法进行验证,不过倒是可以尝试但酶切,是吧

只是很纳闷那么多PCR产物是为何
修身、齐家、治国、平天下
3楼2012-04-20 10:54:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

sunwei57

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你用什么酶做的酶切,同位酶连接后原来的酶是切不开的,质粒稀释100-1000再做PCR
2楼2012-04-19 22:46:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyy_zzz

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-04-20 13:40:49
酶切验证用XhoI 。以原来的载体做模板PCR,如果和附件二20120419 pm pcr 亚克隆结果大致一致,那基本上试验就算失败了。如果不一致,不知道你要扩增的片段多大,要是那条最宽的条带的话,问题貌似不大,你可以提高退火温度试试。多条带出现的原因是很多的,比如不合适的模板,不合适的退火温度等都是原因。
5楼2012-04-20 11:20:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyy_zzz

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

另外,对于问题一,两条带很正常,构象不同而已。浓度低除了操作还可能跟质粒拷贝数和菌浓有关系。
6楼2012-04-20 11:23:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 268求调剂 +5 好运连绵不绝 2026-03-12 5/250 2026-03-17 10:12 by Sammy2
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +3 梨花珞晚风 2026-03-17 3/150 2026-03-17 09:04 by 晗晗调剂上岸
[考研] 318求调剂 +3 Yanyali 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:41 by houyaoxu
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 0703化学调剂,求各位老师收留 +8 秋有木北 2026-03-14 8/400 2026-03-16 15:21 by 哦哦123
[考研] 312求调剂 +3 陌宸希 2026-03-16 4/200 2026-03-16 15:06 by peike
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-16 3/150 2026-03-16 10:07 by 求调剂zz
[考研] 326求调剂 +4 上岸的小葡 2026-03-15 5/250 2026-03-16 08:39 by Linda Hu
[考研] 265求调剂 +4 威化饼07 2026-03-12 4/200 2026-03-14 17:23 by userper
[基金申请] 现在如何回避去年的某一个专家,不知道名字 +3 zk200107 2026-03-12 6/300 2026-03-14 17:13 by zk200107
[考研] b区环境工程求调剂 +4 Maps1 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:23 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +5 牛乳糖的卡卡 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:05 by JourneyLucky
[考研] 0805,333求调剂 +3 112253525 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:42 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +3 番茄头--- 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:07 by JourneyLucky
[考研] 求b区学校调剂 +3 周56 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:20 by JourneyLucky
[考研] 307求调剂 +5 超级伊昂大王 2026-03-12 5/250 2026-03-13 15:56 by 棒棒球手
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 08食品或轻工求调剂,本科发表3篇sci一区top论文,一志愿南师大食品科学与工程 +3 我是一个兵, 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:21 by Yuyi.
[考研] 化工学硕306求调剂 +9 42838695 2026-03-12 9/450 2026-03-13 10:16 by houyaoxu
[考博] 26读博 +4 Rui135246 2026-03-12 10/500 2026-03-13 07:15 by gaobiao
信息提示
请填处理意见