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danyzj01

银虫 (正式写手)

[求助] 提取DNA的时候,为什么要用醋酸钾,用醋酸钠代替或者醋酸钾+氯化钾是否可行?

醋酸钾的作用是什么,仅仅是提供钾离子吗,提供的钾离子发挥什么作用呢?
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-12 13:38:30
danyzj01: 回帖置顶 2012-04-21 09:34:30
引用回帖:
5楼: Originally posted by danyzj01 at 2012-04-11 22:51:26:
请问你用的是什么方法,是文献的还是自己摸索或改进的呢

我们提取植物gDNA,一般采取CTAB法,文献中本来就有改进过多个的版本,我们采取合适的版本,至今沿用下来,没有改过
提取RNA时,采用TRIzol法,我自个按照文献方案进行了20+以上的提取,发现一直存在有A260/230比值过低的问题,最后根据手头资料改进后续步骤后,继续试验5+以上次数后确定有效,才做自行修订方案的。
国外有影响的杂志对实验的重复性要求很高,所以对实验方案的描述要求都是严之又严,采用这类杂志的方案普遍都是没有问题的,若有改进也是在重复多次发现问题反复出现后才思考改进的。
Let God do with it as He wills
6楼2012-04-11 23:04:23
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普通回帖

atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜: 金币+2, 鼓励交流! 2012-04-11 17:24:20
danyzj01: 金币+4, ★★★★★最佳答案 2012-04-21 09:37:35
嗯.................
你指的是核酸共沉剂吗,我一般用NaAc,NaCl,KAc木有用过,不过按照共沉剂的作用是提供一价阳离子中和DNA的负电荷,从而中和DNA分子间排斥作用,以达到共沉淀的效果来看,K离子也是可以用的,但具体没有应用过,不敢乱说
个人看法,若有说错请高手指正
Let God do with it as He wills
2楼2012-04-11 14:06:05
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danyzj01

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by atlanticwi at 2012-04-11 14:06:05:
嗯.................
你指的是核酸共沉剂吗,我一般用NaAc,NaCl,KAc木有用过,不过按照共沉剂的作用是提供一价阳离子中和DNA的负电荷,从而中和DNA分子间排斥作用,以达到共沉淀的效果来看,K离子也是可以用的 ...

他这个方法前面有加NaAC和NaCL,后面又加了点KAC,不知道能否全部替换成NaAC,纯纳离子也是没关系才对吧?
那么有EDTA参与的溶剂可以全部替换成EDTA二钠来使用吗?
3楼2012-04-11 21:32:30
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

★ ★
西瓜: 金币+2, 鼓励交流~ 2012-04-11 22:00:36
引用回帖:
3楼: Originally posted by danyzj01 at 2012-04-11 21:32:30:
他这个方法前面有加NaAC和NaCL,后面又加了点KAC,不知道能否全部替换成NaAC,纯纳离子也是没关系才对吧?
那么有EDTA参与的溶剂可以全部替换成EDTA二钠来使用吗?

1. 如果你是按照某人的文献方法,那在做出结果前一定按照原方法来,不管有多么麻烦,若你重复出结果后,再有空考虑改方法
2. EDTA再溶液中溶解的条件基本都要pH8.0以上了,如果没法溶解,你还要调pH,加NaOH就等同用了二钠,所以没有特定说明下,EDTA和其二钠盐没有区别.......至少偶现在还么见过
Let God do with it as He wills
4楼2012-04-11 21:40:10
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danyzj01

银虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by atlanticwi at 2012-04-11 21:40:10:
1. 如果你是按照某人的文献方法,那在做出结果前一定按照原方法来,不管有多么麻烦,若你重复出结果后,再有空考虑改方法
2. EDTA再溶液中溶解的条件基本都要pH8.0以上了,如果没法溶解,你还要调pH,加NaOH就等 ...

请问你用的是什么方法,是文献的还是自己摸索或改进的呢
5楼2012-04-11 22:51:26
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zyy4581

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西瓜: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-13 18:33:15
额,问题说得不是很清楚,如果是加了EDTA后再用醋酸钾,估计是为了使聚沉更彻底,因为乙二胺四乙酸二钾的溶解度比乙二胺四乙酸二钠更小,更容易沉淀彻底。。。
7楼2012-04-13 16:16:38
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白玉子双

金虫 (小有名气)

醋酸钾的作用是为了减少DNA 的降解,促进DNA与蛋白质的分离。钾离子的作用是为了和提取DNA的Buffer中的EDTA形成沉淀,更利于反冲液的去除,提高DNA 的纯度。
独立做自己
8楼2015-07-29 11:23:44
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