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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 地衣基因组DNA扩增ITS序列，有一个属的物种不出条带是怎么回事
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笑西少

银虫 (小有名气)

[求助] 地衣基因组DNA扩增ITS序列，有一个属的物种不出条带是怎么回事 已有3人参与

各位，我用PCR扩出来几个不同属的地衣ITS序列（我用CTAB法提取的应该是地衣里面真菌的基因组DNA），其他几个属的都可以跑胶跑出来，但是有一个属的所有物种的PCR扩增产物（ITS序列）都跑不出来，大家说这是为啥呢？我觉得我应该针对这个属的物种在跑PCR的时候调整PCR条件，但是怎么调整呢？先提前谢谢大家啦！
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天然产物化学
1楼 2014-06-09 02:33:39
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yuren2009

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
笑西少: 金币+1, ★有帮助 2014-06-09 18:10:00
laozuzunzhe: 金币+1, 鼓励应助！ 2014-06-09 22:58:32
ITS通用引物扩增是由范围的。ITS引物有多对，每对针对物种扩增的属种不同。
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学习使你立于不败之地
2楼2014-06-09 12:59:22
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笑西少

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yuren2009 at 2014-06-09 12:59:22
ITS通用引物扩增是由范围的。ITS引物有多对，每对针对物种扩增的属种不同。

谢谢你的回复！我研究的是地衣嘛，地衣是真菌和藻类的共生体，我扩增的主要是真菌的ITS区段，而且我就用那个特定的区段。我的引物分别是P1：ITS1F和P2：ITS4，我的目的是要建立一个系统进化树。我觉得应该不会换引物吧。我是初学者，不是很清楚这个，先谢谢你啦！
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天然产物化学
3楼2014-06-09 18:20:19
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chenkai1222

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

重新提一下dna，确保有足够的模板
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4楼2014-06-18 09:41:20
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笑西少

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by chenkai1222 at 2014-06-18 09:41:20
重新提一下dna，确保有足够的模板

我模板的量很足的，这个我肯定。后来我改变PCR反应各成分配比，扩出来了。
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天然产物化学
5楼2014-06-18 15:19:43
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李英英

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

跟我做的一样，我也是做地衣但是我是学生态的，我做PCR的目的是鉴定种类
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6楼2014-06-23 18:01:47
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笑西少

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 李英英 at 2014-06-23 18:01:47
跟我做的一样，我也是做地衣但是我是学生态的，我做PCR的目的是鉴定种类

那你遇到过我说的那个问题吗？如果遇到过，你是怎么克服的呢
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天然产物化学
7楼2014-07-01 13:32:57
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