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陌落雅

新虫 (初入文坛)

[求助] 土壤DNA跑pcr一直出现如影随形的两条带,这是为什么

我在做土壤微生物,用试剂盒提取了DNA之后跑pcr,一开始还能出现但一条带,如图一,然后做割胶回收之后再检测发现有很严重的拖带现象,后面再做PCR优化条件的时候就一直出现这个情况:只要能跑出来带,就是如影随形的两条,要不就是一点都没有,如图二,这是什么原因,怎么改进,求教各位大神帮忙:drhttp://muchong.com/bbs/images/smilies/dragon/14.gifagon14:
土壤DNA跑pcr一直出现如影随形的两条带,这是为什么
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土壤DNA跑pcr一直出现如影随形的两条带,这是为什么-1
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zhangbighui

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
陌落雅(amisking代发): 金币+2, 感谢发帖应助,帮助虫子 2013-07-26 17:46:08
我做过破碎全菌后直接跑样后就会出现很多条带,这些条带有DNA还有28S和16S等RNA条带。所以我认为你出现两条条带有可能是DNA提取时没有加RNA酶造成RNA污染引起PCR非特异性条带,不知你提取DNA后有没有做纯度检测。再者你的引物可能设计的特异性不强,因为杂带都是出现在同一位置很均一。三者也是在引物本身是否有二级结构,在PCR过程中形成引物二聚体。胶回收后检测出现杂带可能是DNA降解的结果。你可以再从头做一遍DNA提取,注意每步的纯度检测和评估引物的特异性。祝你实验顺利。
成功,就是成为你想成为的人
2楼2013-07-26 15:53:58
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陌落雅

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangbighui at 2013-07-26 15:53:58
我做过破碎全菌后直接跑样后就会出现很多条带,这些条带有DNA还有28S和16S等RNA条带。所以我认为你出现两条条带有可能是DNA提取时没有加RNA酶造成RNA污染引起PCR非特异性条带,不知你提取DNA后有没有做纯度检测。再 ...

我是最近这段时间做实验才出现两条带的,引物是参考其他已经发表的文献找的,现在准备从头开始再做一遍试试,谢谢大神
3楼2013-07-26 18:14:48
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zhangbighui

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 陌落雅 at 2013-07-26 18:14:48
我是最近这段时间做实验才出现两条带的,引物是参考其他已经发表的文献找的,现在准备从头开始再做一遍试试,谢谢大神...

引物这东西文献上不可全信啊,有些东西还是要自己设计才放心的。一起交流学习。
成功,就是成为你想成为的人
4楼2013-07-26 20:23:46
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陌落雅

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangbighui at 2013-07-26 20:23:46
引物这东西文献上不可全信啊,有些东西还是要自己设计才放心的。一起交流学习。...

因为我的课题要求不需要做到那么精细只是最后要测个丰度,所以大多都是在已发表的文献上面找引物,然后要转化做标线纯化的,不过还是谢谢大神啦~\(≧▽≦)/~
5楼2013-07-27 13:03:59
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