24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3801  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

chendong0625

银虫 (小有名气)

[求助] gromacs grompp的时候出现如下错误

WARNING 1 [file he.top, line 25863]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 2 [file forcefield.itp, line 1]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 3 [file forcefield.itp, line 2]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 4 [file forcefield.itp, line 3]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 5 [file forcefield.itp, line 4]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 6 [file forcefield.itp, line 5]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 7 [file forcefield.itp, line 6]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 8 [file forcefield.itp, line 7]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 9 [file forcefield.itp, line 8]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 10 [file forcefield.itp, line 9]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 11 [file forcefield.itp, line 10]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

-------------------------------------------------------
Program grompp, VERSION 4.5.5
Source code file: topio.c, line: 656

Fatal error:
Syntax error - File forcefield.itp, line 15
Last line read:
'[ defaults ]'
Invalid order for directive defaults
For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS
website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors
-------------------------------------------------------

前面pdb和top文件都建好没问题,加好盒子和溶剂以后,运行grompp能量最小化的时候,出现了以上错误。各位朋友帮忙分析分析,是什么原因?
回复此楼
让我们面对现实,让我们忠于理想。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyy199609

铁虫 (初入文坛)

请问楼主问题解决了吗
5楼2019-04-12 10:24:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

chendong0625

银虫 (小有名气)

懂相关知识的人希望能不吝赐教
让我们面对现实,让我们忠于理想。
2楼2012-03-02 09:15:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蒙延娟

金虫 (初入文坛)

应该是你的动力学参数文件没设置好,可以参考一下别人的mdp文件
let life be beautiful like summer flower !
3楼2012-03-02 09:31:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微米阳光

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chendong0625 at 2012-03-02 09:15:01
懂相关知识的人希望能不吝赐教

请问您的问题后来怎么解决的吗?我也遇到同样问题,却不知道该怎么做。谢谢!
4楼2017-08-01 13:51:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 349求调剂 +5 杰斯塔里斯 2026-03-21 5/250 2026-03-27 00:31 by wxiongid
[考研] 调剂求收留 +7 果然有我 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:26 by wxiongid
[考研] 一志愿北化求调剂 +3 Jsman 2026-03-22 3/150 2026-03-26 21:06 by ajpv风雷
[考研] 求调剂 +5 芦lty 2026-03-25 6/300 2026-03-26 20:49 by 不吃魚的貓
[考研] 求调剂 +6 白QF 2026-03-21 6/300 2026-03-26 20:37 by fmesaito
[考研] 生物学 296 求调剂 +4 朵朵- 2026-03-26 6/300 2026-03-26 19:01 by 不吃魚的貓
[考研] 279求调剂 +6 红衣隐官 2026-03-21 6/300 2026-03-26 18:32 by 不吃魚的貓
[考研] 085602化学工程求调剂。 +4 平乐乐乐 2026-03-26 4/200 2026-03-26 17:57 by fmesaito
[考研] 一志愿北京化工大学材料与化工(085600)296求调剂 +9 稻妻小编 2026-03-26 9/450 2026-03-26 16:16 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿 西北大学 总分282 英语一62 求调剂 +7 18419759900 2026-03-25 7/350 2026-03-26 16:07 by 不吃魚的貓
[考研] 北科281学硕材料求调剂 +17 tcxiaoxx 2026-03-20 19/950 2026-03-26 16:04 by 不吃魚的貓
[考研] 化学调剂一志愿上海交通大学336分-本科上海211 +4 小鱼爱有机 2026-03-25 4/200 2026-03-26 10:19 by aa331100
[考研] 299求调剂 +7 shxchem 2026-03-20 9/450 2026-03-25 10:41 by lbsjt
[考研] 086003食品工程求调剂 +6 淼淼111 2026-03-24 6/300 2026-03-25 10:29 by 3Strings
[考研] 291求调剂 +5 孅華 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:20 by haoshis
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-20 3/150 2026-03-22 14:46 by ColorlessPI
[考研] 285求调剂 +6 ytter 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:09 by 星空星月
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
[考研] 330求调剂0854 +3 assdll 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:01 by 搏击518
[考研] 求调剂 +3 eation27 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:32 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见