24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3797  |  回复: 4

chendong0625

银虫 (小有名气)

[求助] gromacs grompp的时候出现如下错误

WARNING 1 [file he.top, line 25863]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 2 [file forcefield.itp, line 1]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 3 [file forcefield.itp, line 2]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 4 [file forcefield.itp, line 3]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 5 [file forcefield.itp, line 4]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 6 [file forcefield.itp, line 5]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 7 [file forcefield.itp, line 6]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 8 [file forcefield.itp, line 7]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 9 [file forcefield.itp, line 8]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 10 [file forcefield.itp, line 9]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 11 [file forcefield.itp, line 10]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

-------------------------------------------------------
Program grompp, VERSION 4.5.5
Source code file: topio.c, line: 656

Fatal error:
Syntax error - File forcefield.itp, line 15
Last line read:
'[ defaults ]'
Invalid order for directive defaults
For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS
website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors
-------------------------------------------------------

前面pdb和top文件都建好没问题,加好盒子和溶剂以后,运行grompp能量最小化的时候,出现了以上错误。各位朋友帮忙分析分析,是什么原因?
回复此楼
让我们面对现实,让我们忠于理想。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chendong0625

银虫 (小有名气)

懂相关知识的人希望能不吝赐教
让我们面对现实,让我们忠于理想。
2楼2012-03-02 09:15:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蒙延娟

金虫 (初入文坛)

应该是你的动力学参数文件没设置好,可以参考一下别人的mdp文件
let life be beautiful like summer flower !
3楼2012-03-02 09:31:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微米阳光

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chendong0625 at 2012-03-02 09:15:01
懂相关知识的人希望能不吝赐教

请问您的问题后来怎么解决的吗?我也遇到同样问题,却不知道该怎么做。谢谢!
4楼2017-08-01 13:51:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyy199609

铁虫 (初入文坛)

请问楼主问题解决了吗
5楼2019-04-12 10:24:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chendong0625 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 324求调剂 +5 hanamiko 2026-03-26 7/350 2026-03-27 01:05 by muchong357
[考研] 305求调剂 +4 哇卢卡库 2026-03-26 4/200 2026-03-26 20:58 by sanrepian
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-26 3/150 2026-03-26 20:33 by cy128
[考研] 一志愿211院校 344分 东北农业大学生物学学硕,求调剂 +3 丶风雪夜归人丶 2026-03-26 3/150 2026-03-26 19:35 by 求调剂zz
[考研] 279求调剂 +6 红衣隐官 2026-03-21 6/300 2026-03-26 18:32 by 不吃魚的貓
[考研] 352求调剂 +4 大米饭! 2026-03-22 4/200 2026-03-26 16:40 by 不吃魚的貓
[考研] 机械学硕310分,数一英一,一志愿211本科双非找调剂信息 +3 @357 2026-03-25 3/150 2026-03-26 16:34 by by.MENG
[考研] 22 350 本科985求调剂,求老登收留 +4 李轶男003 2026-03-20 4/200 2026-03-26 16:05 by 哇啦啦啦xtj
[考研] 化学调剂一志愿上海交通大学336分-本科上海211 +4 小鱼爱有机 2026-03-25 4/200 2026-03-26 10:19 by aa331100
[考研] 299求调剂 +4 15188958825 2026-03-25 4/200 2026-03-25 22:56 by 418490947
[考研] 308求调剂 +5 墨墨漠 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:19 by 544594351
[考研] 284求调剂 +15 Zhao anqi 2026-03-22 15/750 2026-03-25 12:51 by wht0531
[考研] 求调剂 +5 林之夕 2026-03-24 5/250 2026-03-24 17:16 by dick_runner
[考研] 材料292调剂 +8 橘颂思美人 2026-03-23 8/400 2026-03-24 16:33 by laoshidan
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-21 6/300 2026-03-24 15:03 by 余意卿
[考研] 一志愿华中农业071010,总分320求调剂 +5 困困困困坤坤 2026-03-20 6/300 2026-03-22 17:41 by hxsm
[考研] 求调剂 +5 Zhangbod 2026-03-21 7/350 2026-03-22 13:13 by Zhangbod
[考研] 330求调剂0854 +3 assdll 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:01 by 搏击518
[考研] 085601调剂 358分 +3 zzzzggh 2026-03-20 4/200 2026-03-21 10:21 by luoyongfeng
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
信息提示
请填处理意见