| 查看: 3796 | 回复: 4 | ||
chendong0625银虫 (小有名气)
|
[求助]
gromacs grompp的时候出现如下错误
|
|
WARNING 1 [file he.top, line 25863]: Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501) WARNING 2 [file forcefield.itp, line 1]: Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501) WARNING 3 [file forcefield.itp, line 2]: Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501) WARNING 4 [file forcefield.itp, line 3]: Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501) WARNING 5 [file forcefield.itp, line 4]: Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501) WARNING 6 [file forcefield.itp, line 5]: Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501) WARNING 7 [file forcefield.itp, line 6]: Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501) WARNING 8 [file forcefield.itp, line 7]: Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501) WARNING 9 [file forcefield.itp, line 8]: Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501) WARNING 10 [file forcefield.itp, line 9]: Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501) WARNING 11 [file forcefield.itp, line 10]: Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501) ------------------------------------------------------- Program grompp, VERSION 4.5.5 Source code file: topio.c, line: 656 Fatal error: Syntax error - File forcefield.itp, line 15 Last line read: '[ defaults ]' Invalid order for directive defaults For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors ------------------------------------------------------- 前面pdb和top文件都建好没问题，加好盒子和溶剂以后，运行grompp能量最小化的时候，出现了以上错误。各位朋友帮忙分析分析，是什么原因？ |
回复此楼» 猜你喜欢
复试调剂，一志愿南农083200食品科学与工程
已经有4人回复
-
一志愿太原理工安全工程300分，求调剂
已经有3人回复
-
284求调剂
已经有11人回复
-
食品工程专硕求调剂
已经有3人回复
-
324求调剂
已经有7人回复
-
一志愿武汉理工，总分321，英一数二，求老师收留。
已经有4人回复
-
287求调剂
已经有7人回复
-
325求调剂
已经有5人回复
-
343求调剂
已经有4人回复
-
求调剂推荐 材料 304
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Gromacs中，mdrun出错
已经有5人回复
- 求Gromacs中Glycam力场数据包。。非常感谢
已经有5人回复
- [新手求教]安装Gromacs后，查看pdb2gmx命令，显示无此命令
已经有9人回复
- 【求助】GROMACS分析二面角随时间的变化
已经有4人回复
- 【原创】在gromacs的gro中插入小分子
已经有12人回复
- 【求助】gromacs出现了一个问题
已经有10人回复
- 【求助】求一个gromacs的中文教程，包括安装的部分，小弟新手，从零学起
已经有8人回复
- 【求助】Gromacs和NAMD比Amber快很多吗？如何选择？
已经有7人回复
- 【求助】NAMD和Gromacs哪个简单？
已经有5人回复
- 【求助】求GROMACS模拟表面活性剂在油水表面的行为的例子
已经有7人回复
chendong0625
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 353.6
- 散金: 50
- 帖子: 171
- 在线: 35.6小时
- 虫号: 1092369
- 注册: 2010-09-07
- 专业: 药剂学
2楼2012-03-02 09:15:01
3楼2012-03-02 09:31:07
4楼2017-08-01 13:51:21
5楼2019-04-12 10:24:11
