24小时热门版块排行榜    

查看: 3940  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

chendong0625

银虫 (小有名气)

[求助] gromacs grompp的时候出现如下错误

WARNING 1 [file he.top, line 25863]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 2 [file forcefield.itp, line 1]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 3 [file forcefield.itp, line 2]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 4 [file forcefield.itp, line 3]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 5 [file forcefield.itp, line 4]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 6 [file forcefield.itp, line 5]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 7 [file forcefield.itp, line 6]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 8 [file forcefield.itp, line 7]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 9 [file forcefield.itp, line 8]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 10 [file forcefield.itp, line 9]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

WARNING 11 [file forcefield.itp, line 10]:
  Too few parameters on line (source file toppush.c, line 1501)

-------------------------------------------------------
Program grompp, VERSION 4.5.5
Source code file: topio.c, line: 656

Fatal error:
Syntax error - File forcefield.itp, line 15
Last line read:
'[ defaults ]'
Invalid order for directive defaults
For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS
website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors
-------------------------------------------------------

前面pdb和top文件都建好没问题,加好盒子和溶剂以后,运行grompp能量最小化的时候,出现了以上错误。各位朋友帮忙分析分析,是什么原因?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

让我们面对现实,让我们忠于理想。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蒙延娟

金虫 (初入文坛)

应该是你的动力学参数文件没设置好,可以参考一下别人的mdp文件
let life be beautiful like summer flower !
3楼2012-03-02 09:31:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

chendong0625

银虫 (小有名气)

懂相关知识的人希望能不吝赐教
让我们面对现实,让我们忠于理想。
2楼2012-03-02 09:15:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微米阳光

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chendong0625 at 2012-03-02 09:15:01
懂相关知识的人希望能不吝赐教

请问您的问题后来怎么解决的吗?我也遇到同样问题,却不知道该怎么做。谢谢!
4楼2017-08-01 13:51:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyy199609

铁虫 (初入文坛)

请问楼主问题解决了吗
5楼2019-04-12 10:24:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +31 医学老男孩 2026-08-13 69/3450 2026-08-16 00:16 by mo_mo_mo_mo
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +12 Tide man 2026-08-10 13/650 2026-08-15 16:34 by 氺木
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +7 Ldrop2023 2026-08-13 7/350 2026-08-15 15:57 by mzhh2000
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
信息提示
请填处理意见