24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2073  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

张晓梅ZXM

金虫 (正式写手)

meimeizhang

[求助] 为何PCR产物测序只测一部分?

想做一些看家基因分析,文献给的扩增引物和测序引物信息(位点)结果如下:
F:1162-1190      R:2126-2155  扩增产物994bp
F1:1273-1291    R1:2135-2152  测序产物879bp  实际测得540bp

问题一:为何测序只测PCR扩出来的一部分?如果本来只需这一小段的话为何不直接扩这一段?

问题二:根据测序引物的位点推测产物应该是879bp,为何实际测序结果是540bp?

很困惑,请教大虾!感激不尽!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

每天进步一点点,持之以恒!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张晓梅ZXM

金虫 (正式写手)

meimeizhang

引用回帖:
8楼: Originally posted by 海阔天空8158 at 2012-02-24 14:12:09:
这个就要看你的文章里到底是怎样处理的,是什么目的了。
如果可以的话,可以把文献共享一下。这样会更有针对性。

感兴趣的话可以看一下,也可能是我看文献时候信息没有领会全面,欢迎讨论和指教!

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 2008_MLSA_for_Streptomycete_Systematics.pdf
  • 2012-02-24 22:21:16, 466.17 K
每天进步一点点,持之以恒!
10楼2012-02-24 22:22:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

smilerion

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
小丹木木(金币+1): 鼓励应助 2012-02-23 08:16:07
因为扩增引物结合在模板上,测序引物是是结合在需要测序的PCR产物上的。
同时测序的结果在前100bp左右是不准的,一般不参考。
2楼2012-02-23 02:56:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张晓梅ZXM

金虫 (正式写手)

meimeizhang

引用回帖:
2楼: Originally posted by smilerion at 2012-02-23 02:56:50:
因为扩增引物结合在模板上,测序引物是是结合在需要测序的PCR产物上的。
同时测序的结果在前100bp左右是不准的,一般不参考。

你的意思我明白,可我的问题还是没有搞明白
一般PCR产物测序就直接用PCR的引物测,可它这为何是在PCR的目的产物中间选的引物来测序?
测序前100bp确实不宜参考,可我看它那差的是300多bp啊?
为什么呢?
每天进步一点点,持之以恒!
3楼2012-02-23 09:34:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

若水5886

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
小丹木木(金币+2): 鼓励应助 2012-02-24 15:18:57
首先要说明测序引物比扩增引物的要求要高,比如Tm值,GC含量,序列结构,要在保守区等,有时候设计扩增引物为了保证扩增出来的质量,不能和测序引物兼容。
其次,如果测出来的序列只有500多,那么你用扩增引物或者测序引物扩增出来的片段有多大?目标序列少很多肯定不对的
4楼2012-02-23 10:17:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿华中农业071010,320求调剂 +12 困困困困坤坤 2026-04-14 14/700 2026-04-16 10:18 by beilsong20
[考研] 273求调剂 +6 白居不易. 2026-04-09 8/400 2026-04-15 22:02 by wooluyong
[考研] 一志愿A区211,22408 321求调剂 +6 随心所欲☆ 2026-04-15 7/350 2026-04-15 21:45 by lbsjt
[考研] 求助调剂,跨调 +19 X十甫寸Y 2026-04-11 20/1000 2026-04-15 21:18 by cuisz
[考研] 085404 22408 309分求调剂 +9 lzmk 2026-04-14 10/500 2026-04-15 20:02 by 学员JpLReM
[考研] 22专硕求调剂 +9 haoyun上岸 2026-04-11 11/550 2026-04-15 14:47 by elainzaizai
[考研] 药学305求调剂 +10 玛卡巴卡boom 2026-04-10 10/500 2026-04-14 15:55 by zs92450
[考研] 290求调剂 +21 luoziheng 2026-04-10 23/1150 2026-04-14 15:49 by zs92450
[考研] 一志愿沪9,326求生物学调剂 +10 刘墨墨 2026-04-13 10/500 2026-04-14 15:16 by zs92450
[考研] 人工智能320调剂08工类还有机会吗 +18 振—TZ 2026-04-10 19/950 2026-04-14 10:34 by screening
[考研] 本科西工大 324求调剂 +5 wysyjs25 2026-04-10 5/250 2026-04-13 23:08 by pies112
[考研] 材料复试求调剂 +24 xhhdjdjsjks 2026-04-09 24/1200 2026-04-13 15:49 by 幸免 ..
[考研] 291求调剂 +8 关忆北. 2026-04-11 8/400 2026-04-12 09:32 by 逆水乘风
[考研] 化工调剂求导师收留!一志愿失利,踏实肯干,有植物提取科研经历 +20 yzyzx 2026-04-09 21/1050 2026-04-12 00:12 by 小小小小啦啦啦
[考研] 343求调剂 +9 王国帅 2026-04-10 9/450 2026-04-11 20:31 by dongdian1
[考研] 求调剂,一志愿大连理工大学354分 +5 雨声余生 2026-04-11 6/300 2026-04-11 16:12 by 雨声余生
[考研] 0859,337求调剂 +4 研s. 2026-04-10 4/200 2026-04-11 11:34 by caotw2020
[考研] 22408 352分求调剂0854类 +4 努力的夏末 2026-04-09 4/200 2026-04-11 09:57 by zhq0425
[考研] 中药学调剂 初试324 +4 洋甘菊、 2026-04-10 6/300 2026-04-11 09:41 by gong120082
[考研] 314求调剂 +14 weltZeng 2026-04-09 14/700 2026-04-09 23:14 by wolf97
信息提示
请填处理意见