| 查看: 2171 | 回复: 5 | ||
| 本帖产生 1 个 模拟EPI ，点击这里进行查看 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
trr文件如何输出
|
||
| 进行模拟的时候没有让输出trr文件，但是现在发现要用到那个文件，用什么样的命令可以得到这个文件呢，望指点 |
回复此楼» 猜你喜欢
被我言中：新模板不强调格式了，假专家开始管格式了
已经有3人回复
-
085600材料与化工求调剂
已经有5人回复
-
材料与化工求调剂
已经有5人回复
-
277调剂
已经有4人回复
-
290求调剂
已经有4人回复
-
材料工程专硕调剂
已经有3人回复
-
26考研求调剂
已经有6人回复
-
求调剂，总分315，考的生物医药，一志愿湖南师范大学。调剂到任何专业都可以
已经有5人回复
-
311求调剂
已经有7人回复
-
303求调剂
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 在服务器控制台archive，手动存档后，输出文件是存在哪里的啊
已经有23人回复
- 求助：如何将输出文件转化为分子轨道及HOMO和LUMO 求简单文字攻略步骤
已经有9人回复
- 如何从高斯输出文件快速提出 pai 轨道信息。
已经有7人回复
- 急！！！Sorption 做吸附后在输出文件中出现C/D Ratio=0/0。
已经有24人回复
- 【求助】在原有输出文件的基础上增加输出的方法
已经有6人回复
- 【转帖】GROMACS分析程序讨论，在gromacs中添加Amber力场
已经有8人回复
- 【求助】请教怎么从trr文件中导出坐标【已解决】
已经有9人回复
- 【求助】vasp中COOP如何理解及输出文件如何处理？
已经有12人回复
- 【求助】如何读取输出文件中的键级
已经有4人回复
- 【求助】求一个gromacs的中文教程，包括安装的部分，小弟新手，从零学起
已经有8人回复
- 【求助】如何将Gaussian输出文件导入AIM2000中？
已经有10人回复
- 【求助】怎样读gaussian输出文件
已经有5人回复
- 【求助】如何在以下高斯03输出文件中得到二阶超极化率
已经有15人回复
- 【求助】GV输出的Oniom输入文件如何修改
已经有17人回复
【答案】应助回帖
蓝紫色玻璃心(金币+5): 2012-02-14 11:54:09
御剑江湖(模拟EPI+1): 谢谢 2012-02-17 22:11:39
|
也就是说你想接着上一步的模拟，继续增加模拟时间，是这样吧？ 如果你的初始MDP文件中设置的模拟时间就很长，没有算完，想继续往下算的话，直接读入前一个断点（.cpt文件）就行了 ，在的mdrun 命令中加入-cpi 就可以把最初始设置的模拟时间算完。这中情况不需要.trr文件。 如果你初的MDP文件中设置的模拟时间已经算完了，想继续模拟下去，就更简单了，把你上一步得到的.gro文件作为继续模拟的初始结构，就可以了啊。也不需要以前的.trr 文件，如果你以后需要的话，可以在继续模拟的MDP文件中让.trr 文件输出出来。 |
蓝紫色玻璃心4楼2012-02-10 09:58:38
2楼2012-02-10 09:46:35
3楼2012-02-10 09:49:29
5楼2012-02-10 10:45:17
5