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jiaoyixiong

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【答案】应助回帖


蓝紫色玻璃心(金币+5): 2012-02-14 11:54:09
御剑江湖(模拟EPI+1): 谢谢 2012-02-17 22:11:39
引用回帖:
3楼: Originally posted by 蓝紫色玻璃心 at 2012-02-10 09:49:29:
我的模拟感觉时间不是很充足,所以想延长一点时间,但是需要这个trr文件,难道说只能重新开始了吗这样的话?

也就是说你想接着上一步的模拟,继续增加模拟时间,是这样吧?

如果你的初始MDP文件中设置的模拟时间就很长,没有算完,想继续往下算的话,直接读入前一个断点(.cpt文件)就行了 ,在的mdrun  命令中加入-cpi  就可以把最初始设置的模拟时间算完。这中情况不需要.trr文件。

如果你初的MDP文件中设置的模拟时间已经算完了,想继续模拟下去,就更简单了,把你上一步得到的.gro文件作为继续模拟的初始结构,就可以了啊。也不需要以前的.trr 文件,如果你以后需要的话,可以在继续模拟的MDP文件中让.trr 文件输出出来。

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4楼2012-02-10 09:58:38
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