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trr文件如何输出
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| 进行模拟的时候没有让输出trr文件,但是现在发现要用到那个文件,用什么样的命令可以得到这个文件呢,望指点 |
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蓝紫色玻璃心(金币+5): 2012-02-14 11:54:09
御剑江湖(模拟EPI+1): 谢谢 2012-02-17 22:11:39
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也就是说你想接着上一步的模拟,继续增加模拟时间,是这样吧? 如果你的初始MDP文件中设置的模拟时间就很长,没有算完,想继续往下算的话,直接读入前一个断点(.cpt文件)就行了 ,在的mdrun 命令中加入-cpi 就可以把最初始设置的模拟时间算完。这中情况不需要.trr文件。 如果你初的MDP文件中设置的模拟时间已经算完了,想继续模拟下去,就更简单了,把你上一步得到的.gro文件作为继续模拟的初始结构,就可以了啊。也不需要以前的.trr 文件,如果你以后需要的话,可以在继续模拟的MDP文件中让.trr 文件输出出来。 |
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