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trr文件如何输出
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| 进行模拟的时候没有让输出trr文件，但是现在发现要用到那个文件，用什么样的命令可以得到这个文件呢，望指点 |
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3楼2012-02-10 09:49:29
2楼2012-02-10 09:46:35
【答案】应助回帖
蓝紫色玻璃心(金币+5): 2012-02-14 11:54:09
御剑江湖(模拟EPI+1): 谢谢 2012-02-17 22:11:39
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也就是说你想接着上一步的模拟，继续增加模拟时间，是这样吧？ 如果你的初始MDP文件中设置的模拟时间就很长，没有算完，想继续往下算的话，直接读入前一个断点（.cpt文件）就行了 ，在的mdrun 命令中加入-cpi 就可以把最初始设置的模拟时间算完。这中情况不需要.trr文件。 如果你初的MDP文件中设置的模拟时间已经算完了，想继续模拟下去，就更简单了，把你上一步得到的.gro文件作为继续模拟的初始结构，就可以了啊。也不需要以前的.trr 文件，如果你以后需要的话，可以在继续模拟的MDP文件中让.trr 文件输出出来。 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
蓝紫色玻璃心4楼2012-02-10 09:58:38
5楼2012-02-10 10:45:17
40