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xinshi

银虫 (正式写手)

[求助] SDS-PAGE与蛋白质内部共价健的关系

请教一个问题,我有一个蛋白,含有二硫键的,用分析柱分析结果,聚体占70%,单体占30%,但是跑非还原的SDS-PAGE,结果聚体占60%,单体占40%。是不是能说明蛋白质聚体里面10%是非二硫键(比如可能是氢键)结合的,跑电泳的时候被打断了,转化成单体了???还是说蛋白内部还有非共价结合的???SDS-PAGE能反映蛋白内部结合的情况吗???
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

楼主,我来说几句吧,希望能给你解解惑!

1. SDS-page只是用来定性检测蛋白的,并不能用来定量检测!无论是还原性还是费还原性的,因为你跑SDS-page时,胶是有一定厚度的,你要用立体的三维空间结构去想象,并不是在照片上反映的二维平面考马斯亮蓝染色的深浅度,然后你再通过PS粗估浓度的!(希望你能想象和理解!!!
2.非还原性SDS-page并不能完全打开非共价键形成的二聚体或多聚体!我曾今做过一个因子,human NT-4,他的非共价键式的二聚体才具有活性!当时我仍在非还原性胶上检测出来了!!!要想完全打开非共价键形式的二聚体,或许可以通过含有Urea的SDS-PAGE!
3.要想准确的分析你的蛋白到底单体与聚体分别占多少!其实你的分析柱就能说明问题!要想更严谨点,可以送给有关公司打个HPLC!
以上是我个人意见,希望有所帮助!!
长得比我英俊的,没我有才华!有才华的,没我长得俊!
6楼2013-05-12 19:10:50
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lcppp1974

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流! 2012-02-03 20:34:51
60%和70%是非常接近的,故不能作为差来看!而且氢键不是共价键,所以不用考虑。你说的转化为单体,一般情况下是不会的。建议你跑尿素PAGE,4 M的尿素可以打断氢键
2楼2012-02-03 16:23:39
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花的泪

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个在误差以内,非还原SDS-PAGE 没有还原剂,不能打开二硫键
3楼2012-02-03 16:55:41
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巫圣逸

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
刚刚开始研究这一切好陌生啊!!!!!!!
不以物喜,不以己悲
4楼2012-02-04 21:27:36
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