应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 谁能帮我分析一下系统进化树？
51/1返回列表
查看: 4091  |  回复: 7
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 1 个 BioEPI ，点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

lct515

新虫 (著名写手)

[求助] 谁能帮我分析一下系统进化树？

我做了一个菌种的系统进化树，但是不太会分析。请教高手帮我分析一下。具体见附件
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2012-01-14 14:39:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刘文瑶

新虫 (小有名气)
选菌就没选好，异源菌没必要选那么多，你这个就是说明了你的菌属于Pseudomomas aeruginosa 这个属的了。前面有些分支的数值较低，可信度不好！
赞一下 回复此楼
6楼2012-01-16 10:43:28
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

henrylee223

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
lct515(金币+2): ★★★很有帮助 感谢你的回答 2012-01-14 16:40:30
silicare(金币+3): 谢谢参与 2012-02-20 12:51:33
首先，根据进化树分析，你的不同菌种分为两个大的类群，然后再在两个类群内细分：类群1上面的可先分为连个小的类群，S30 和PHS-1为一个，其余为另一小类；然后再细分。类群2下面的也可分为连个小类，s89和mn17-9位一类，其余位一类。
赞一下 回复此楼
2楼2012-01-14 16:15:48
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lct515

新虫 (著名写手)
这两个大的类群之间有什么关系呢？另一个类群与我的菌株又有什么关系呢？
赞一下 回复此楼
3楼2012-01-14 16:37:03
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gjs713

至尊木虫 (职业作家)
依我个人做系统树的经验 你这个树有些问题：
在查找同源序列的时候，一般同属不同种的只需要找2-3个就够了。
以sp结尾的这种菌种序列我们一般不选取，因为它还没有确定种属，对于构建系统发育树确定种属来说并没有指导作用。
另外，这个树没有比例尺，这个很重要。
在最后我们一般还会选取一个远源的外属序列作为对照，当然这个并不是必不可少的。
赞一下(1人) 回复此楼
勤奋、执着、专注，则无坚不破。
4楼2012-01-15 20:05:45
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭