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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 小片段DNA电泳看不见条带
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yuezhixian

铜虫 (初入文坛)

[求助] 小片段DNA电泳看不见条带

PCR产物酶切后目的片段长度分别为121BP，98BP和23BP，用3%琼脂糖凝胶电泳30min，电压150V，仅可见121bp和98bp两条带，连MARKER中长度为26bp的条带都没有看见，如果不跑30min，MARKER条带又跑不开。请问各位大侠，这要如何调整才可以跑出小片段DNA？
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扎实做好每一步，不急不躁！
1楼 2011-12-14 20:12:40
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜(金币+1): Good! 2011-12-15 23:36:27
可以用PAGE胶分离。特别小的DNA用agrose胶分离效果本来就差，时间短了分不开，时间长了又扩散不见了。
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2楼2011-12-14 20:42:46
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yuezhixian

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
楼: Originally posted by lxj341401 at 2011-12-14 20:42:46:
可以用PAGE胶分离。特别小的DNA用agrose胶分离效果本来就差，时间短了分不开，时间长了又扩散不见了。

需要加SDS吗？
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扎实做好每一步，不急不躁！
3楼2011-12-14 20:56:05
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wcx蜗牛

无虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜(金币+1): 有可能 2011-12-15 23:37:06
是不是时间长了MARKER中长度为26bp的跑出去了，小分子用sds-PAGE胶分离胶试试
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4楼2011-12-14 22:37:34
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匿名

用户注销 (正式写手)
★
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西瓜(金币+1): 鼓励应助 2011-12-15 23:37:15
本帖仅楼主可见
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5楼2011-12-15 09:29:05
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wccc

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
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西瓜(金币+1): 欢迎交流经验！ 2011-12-15 23:37:26
聚丙烯酰胺凝胶电泳，150V，2h，20bpMarker，效果很好
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6楼2011-12-15 10:25:40
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xielinqi

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜(金币+1): 鼓励交流 2011-12-15 23:37:38
电压小一点，少跑会儿，可能是片段太小已经跑出胶外了
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7楼2011-12-15 10:58:13
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果子么么茶

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
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西瓜(金币+1): 鼓励应助 2011-12-15 23:37:55
二十多片段本来就小  染料都没结合上多少 就算没出胶外 也很难看清  酶切体系大点 加大上样量试试 祝成功

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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8楼2011-12-15 13:32:26
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shine372

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
marker条带也没有看见的话，可以试试加大胶浓度，同时减小电压120-130V，缩短电泳时间20-25min，加大上样量
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9楼2011-12-15 21:35:14
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kidluag

金虫 (正式写手)

不自信的师生

【答案】应助回帖

同意楼上诸位观点可采用PAGE，但是应该不用加SDS吧。也可在加大点样量的同时缩短时间或减小电压，3%浓度已经不算小了
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被迫的无知小小博
10楼2013-05-26 01:56:59
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