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woshiai

银虫 (小有名气)

[求助] 分子生物学基础问题,关于基因方向,求帮助

如图是我在UCSC上截取的图片,AK076684 为未知功能基因,Prex1为蛋白编码基因,请高手帮忙解答一下这两个基因的位置关系,及功能可能的关系,实验急需,非常谢谢!

UCSC截取图片
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cdl007

木虫 (正式写手)

恕我眼拙,没看到AK076684
2楼2011-11-17 16:20:02
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cdl007

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
woshiai(金币+3): 谢谢回复,但我还有不明白的地方,希望继续解惑! 2011-11-17 17:04:22
西瓜(金币+3): 辛苦啊! 2011-11-17 19:37:13
哦,最后一行,找到了,哄哄
其实通常来说在一个基因上游 2k左右主要是其启动子的调控位置,当两个基因在这个距离的时候,可以考虑两个基因的共表达,或者说伴随表达,或伴随调控,也就是说在AK076684 的更上游会有一部分调控位点

个人想法,不权威,欢迎讨论
3楼2011-11-17 16:28:36
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woshiai

银虫 (小有名气)

可是这两个基因方向不一致啊,能确定AK076684是Prex1的上游吗?
4楼2011-11-17 17:03:22
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woshiai

银虫 (小有名气)

还有能确定他们在一条链上吗?
不好意思,有些基础知识可能没弄明白,说的不合适的地方还请指正!
5楼2011-11-17 17:08:49
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xenopus

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

woshiai(金币+3): 谢谢答复,我想知道有没有可能前者调控后者表达^_^,再次感谢! 2011-11-18 16:49:19
看图的话两个基因方向相反,上游调控序列应该不同,所以共表达的可能很小。至于功能上的关系,不会预测。
6楼2011-11-18 10:58:35
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zhwlsy

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
mengfei8336(金币+2): Thank you. 2011-11-19 09:37:17
woshiai(金币+4): 谢谢,这几天忙试验,没来看。 2011-11-23 08:31:02
基因的位置相连不能预测功能关系,如果是基因簇还有可能有相互作用,但是这个好像不是,如果确实想知道二者的功能是否相关,可以去其他生物找找同源基因的功能,这样可以有点指导意义!
神秘的分子生物学
7楼2011-11-18 21:55:02
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