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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 关于PCR退火温度
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hgq115

金虫 (小有名气)

[交流] 关于PCR退火温度

PCR引物设计的时候，用不同的软件设计会发现同一个引物的Tm值相差比较大，与用4（G+C）*2(A+T)获得的结果也不同。请问各位虫友在设计的时候是如何确定引物的Tm值的？
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1楼2011-10-20 09:47:43
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cloverplm

金虫 (小有名气)
★
hgq115(金币+1):谢谢参与
hgq115(金币+4): 2011-10-20 18:06:26
设计引物时Tm 值以软件计算值为参考，不要太高或太低就行，实际合成引物后，由于离子浓度的不同，导致退火温度有所改变，以公司引物合成报告单为参考，上下浮动5℃的值都可以P。可以通过梯度PCR决定最合适的退火温度。
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11楼2011-10-20 16:52:11
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lixg

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★
hgq115(金币+1):谢谢参与
adslye(金币+2): 鼓励交流，TM计算公式不同而已，没有对错。 2011-10-21 08:54:35
利用软件引物，实际Tm值以公司的报告为准。
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2楼2011-10-20 09:50:22
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sunqinyan

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
hgq115(金币+1):谢谢参与
adslye(金币+2): 鼓励交流！ 2011-10-21 08:54:45
primer 5.0设计的时候就会给
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2011-10-20 10:38:27
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nuoyaeva

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★
hgq115(金币+1):谢谢参与
adslye(金币+2): 鼓励交流！55王道~ 2011-10-21 08:55:03
跑PCR的时候一律55度的飘过....
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4楼2011-10-20 11:30:06
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