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王玉民

新虫 (小有名气)

[求助] 求助:请问做TOPO克隆时总是连接不上怎么回事啊?

请教高手:
我用Pfu酶扩增得到大约500bp的片段,与TOPO载体连接时,连接转化后总是不长斑是怎么回事啊?
有没有做过TOPO克隆的有什么好的经验指导一下啊?
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心晴
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另一个天堂

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
amisking(金币+3): 鼓励应助发帖! 2011-10-11 21:56:13
1.涂板:玻璃棒温度过高或离酒精灯太近被烧死了:或者涂板时液体没涂干
2.确定目的基因是否连接上了载体
3.检验一下你的扩增片段
4.考虑是不是培养基的问题
2楼2011-10-11 09:58:25
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王玉民

新虫 (小有名气)

多谢!再请问1.如何确定是否连接上了载体?
2.如何检测扩增片段是否正确,大小用琼脂糖检测的是正确的,末端如何检测呢?
3.连接产物和感受态的比例多少最合适呢?
心晴
3楼2011-10-11 10:18:05
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yuxia82012

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

不会是感受态效率不高所致吧?
在等待中涅槃重生
4楼2011-10-11 14:36:47
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
1楼: Originally posted by 王玉民 at 2011-10-11 09:25:09:
请教高手:
我用Pfu酶扩增得到大约500bp的片段,与TOPO载体连接时,连接转化后总是不长斑是怎么回事啊?
有没有做过TOPO克隆的有什么好的经验指导一下啊?

TOPO vector 是invitrogen公司的一个TA克隆的质粒载体系列。http://tools.invitrogen.com/content/sfs/manuals/topota_man.pdf
Pfu酶是高保真酶,扩增后不带A的,所以你扩增得到大约500bp的片段如果没有经过加A处理,是不能直接用于TOPO vector做TA克隆的。
5楼2011-10-11 14:47:04
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xiaoshu8833

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by lxj341401 at 2011-10-11 07:47:04:
TOPO vector 是invitrogen公司的一个TA克隆的质粒载体系列。http://tools.invitrogen.com/content/sfs/manuals/topota_man.pdf
Pfu酶是高保真酶,扩增后不带A的,所以你扩增得到大约500bp的片段如果 ...

这个答案靠谱~~要自己加一步的~~
PS:你扩增的片段纯化回收的方法也可能对后面的连接有影响~~
Boncourage
6楼2011-10-11 17:41:17
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另一个天堂

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 王玉民 at 2011-10-11 10:18:05:
多谢!再请问1.如何确定是否连接上了载体?
2.如何检测扩增片段是否正确,大小用琼脂糖检测的是正确的,末端如何检测呢?
3.连接产物和感受态的比例多少最合适呢?

你请教一下5楼吧,看你用的是pfu酶。我们实验是一般用国产酶做转化
7楼2011-10-12 10:29:35
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王玉民

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by xiaoshu8833 at 2011-10-11 17:41:17:
这个答案靠谱~~要自己加一步的~~
PS:你扩增的片段纯化回收的方法也可能对后面的连接有影响~~

TOPO载体要求的连接片段是平端的,所以我才用Pfu酶去掉A的。
再请问一下,做转化的时候连接产物和感受态的比例是多少最合适呢?
心晴
8楼2011-10-12 11:52:35
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xiaoshu8833

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 王玉民 at 2011-10-12 04:52:35:
TOPO载体要求的连接片段是平端的,所以我才用Pfu酶去掉A的。
再请问一下,做转化的时候连接产物和感受态的比例是多少最合适呢?

这样哦~~我也用Pfu酶,不过我不用TOPO载体~~
转化的时候连接产物和感受态的推荐比例是3:1,不过这个不是死的规定,我一般会弄个1:1的一个3:1的,看哪个更好~~
Boncourage
9楼2011-10-14 18:27:05
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沙门小rna

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by lxj341401 at 2011-10-11 14:47:04
TOPO vector 是invitrogen公司的一个TA克隆的质粒载体系列。http://tools.invitrogen.com/content/sfs/manuals/topota_man.pdf
Pfu酶是高保真酶,扩增后不带A的,所以你扩增得到大约500bp的片段如果没有经过加A处 ...

这个问题,貌似我做过pfu直接连的。。。没验证出来。。后来加 了rtaq酶。
应助之星就是我~没错。你没有看错~
10楼2013-10-27 11:34:11
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