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张小逸

铜虫 (小有名气)

[求助] 引物设计的问题

引物的设计是不是都是用软件进行?还是人工自己来,本人新手,最近在做RAPD,引物设计方面碰到了不少问题,求指教!谢谢
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yc652090251

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

adslye(BioEPI+1): 鼓励新虫!回复得很详细!~国庆快乐~ 2011-09-30 17:06:16
张小逸(金币+1): 非常感谢,很受用 2011-10-07 08:42:43
① 无需专门设计RAPD 扩增反应引物,也无须预先知道被研究生物基因组的核苷酸序列,引物可随机合成和随机选定,长度一般为9- 10 个核苷酸; ② 每个RAPD 反应中,仅加单个引物,就可通过引物和模板DNA 随机配对实现扩增,扩增无特异性;   
③ 退火温度低,一般为36℃,这样的温度能保证核苷酸引物与模板的稳定结合,同时允许适当的错误配对,以扩大引物在基因组DNA中配对的随机性,使RAPD 有较高的检出率;   
④  RAPD 分析所需的DNA 样品量极少
低调做人好么~~
4楼2011-09-30 14:12:52
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18853850850

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
adslye(金币+2): 鼓励交流~国庆快乐~ 2011-09-30 17:05:22
用软件,primer5.0和DNAstar,本人觉得后一个软件好用一些!
学自己想知道的
2楼2011-09-30 09:44:04
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tdhslxiaoyao

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

一般是用软件的,很多最后还是要手动的,软件就是辅助的
5楼2011-09-30 15:15:44
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张小逸

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yc652090251 at 2011-09-30 14:12:52:
① 无需专门设计RAPD 扩增反应引物,也无须预先知道被研究生物基因组的核苷酸序列,引物可随机合成和随机选定,长度一般为9- 10 个核苷酸; ② 每个RAPD 反应中,仅加单个引物,就可通过引物和模板DNA 随机配对实 ...

关于产物的多态性,总的位点数是指的条带总数吧,那么多态位点书是指的什么呢?谢谢
6楼2011-10-07 16:39:46
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