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lynic

新虫 (初入文坛)

[求助] SDS-PAGE出现奇怪的拖尾

本科时候跑了一年的E.coli,从来没出现这种情况:

用Pre-cast的胶,前两次跑过没问题,条带清晰蛋白分离很好;电泳缓冲液也是公司的,自己稀释,也是没问题的。电压一直是200V。跑的是全菌,不诱导表达的那种

现象:同一片胶Marker和另一种菌没有拖尾,但是E.coli拖尾严重,跑的时候就看到了,染色后一片模糊。E.coli的样品是新制的,小试管2ml培养7小时,样品处理方式不变,收菌后dI WATER洗两次,加loading buffer煮5分钟,上样量不大(按之前的经验值,上两次跑出的条带清晰分明)。

跑完以后想会不会是杂菌污染之类的问题,或者摇菌时间过长(36C,200rpm),重新挑单菌落接种,4小时培养。煮菌后不到5分钟就上样了依然拖尾,Marker和另一种菌则没有拖尾!!第二次跑胶时候看到上样孔那有残留物,但我确定用移液枪吸取样品时候没有粘稠状的东西~


求助各位,是不是DNA降解呢?但是之前相同条件,跑E.coli全菌,一直没有这种情况发生,即使是反复冻融的样品或者过夜培养,都没出现类似问题。请问出现了什么问题我忽略了的,应该怎么解决呢?

[ Last edited by 1949stone on 2011-9-29 at 11:39 ]
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分子菜鸟

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西瓜(金币+3): good 2011-09-27 13:44:39
加上样缓冲液是不是混得不太均匀。上样孔要是有残留物应该是菌没煮好,加点8M尿素裂解一下,多煮一会,点样量小一点。
2楼2011-09-27 10:43:21
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sapphire7000

新虫 (初入文坛)

学习中,,,,,,,,,
3楼2011-09-27 11:57:49
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nach

铜虫 (著名写手)

不让吃就去死

【答案】应助回帖

不用超声破碎的吗
不让吃就去死
4楼2011-09-27 19:59:24
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eileen8519

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
dhd997(金币+2): good 2011-09-28 07:22:28
估计是蛋白浓度过高,条带没有分开,你减少加样量试试。我以前跑破碎细胞的沉淀,加过了之后,带型根本没有分开,就像你说的拖尾。
5楼2011-09-27 23:29:49
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lynic

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by nach at 2011-09-27 19:59:24:
不用超声破碎的吗

提取包涵体我才用超声破碎的,一般跑个全菌图用不着
6楼2011-09-29 10:32:52
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lynic

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 分子菜鸟 at 2011-09-27 10:43:21:
加上样缓冲液是不是混得不太均匀。上样孔要是有残留物应该是菌没煮好,加点8M尿素裂解一下,多煮一会,点样量小一点。

缓冲液公司的,均匀稀释;之前煮菌时间一样,5min,上样量有之前的经验值,肯定不高;

7楼2011-09-29 10:50:47
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lynic

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
1楼: Originally posted by lynic at 2011-09-26 01:15:01:
本科时候跑了一年的E.coli,从来没出现这种情况:

用Pre-cast的胶,前两次跑过没问题,条带清晰蛋白分离很好;电泳缓冲液也是公司的,自己稀释,也是没问题的。电压一直是200V。跑的是全菌,不诱导表达的那种
...

这是第一次跑的胶,什么参数条件都一样,E.coli的全菌

8楼2011-09-29 10:54:18
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JASON13

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


西瓜(金币+1): good 2011-09-29 18:47:21
确定没染噬菌体?bl21有时易染噬菌体。
结构化生
9楼2011-09-29 15:54:20
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lynic

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by JASON13 at 2011-09-29 15:54:20:
确定没染噬菌体?bl21有时易染噬菌体。

应该没有;实验室不做噬菌体,就连E.coli也不经常培养
10楼2011-09-30 02:04:47
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