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weimei0110

金虫 (小有名气)

[求助] 求教:随机序列PCR产物 PAGE和琼脂糖电泳问题

各位高手,我的问题是这样的:
PCR模板为一段单链人工合成的DNA序列,107个碱基,中间70个是随机序列。经过PCR之后,得到约130bp左右的序列(5‘引物有启动子)。但是同样的PCR产物在8%的非变性PAGE里和2%的琼脂糖中条带位置差别很大,PAGE里大概在250bp附近,琼脂糖中大概在130bp附近。重复试验很多次,都是这样的结果。请问各位,可能是什么原因呢?

M1是takara20bp的小分子DNAmarker,M2是takaraDL2000的marker,2号是原来的一个随机样品,在两份胶中位置一样,样品泳道是我的PCR样品。


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weimei0110

金虫 (小有名气)

自己顶下  还望高手多多指点啊
2楼2011-09-23 10:39:14
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weimei0110

金虫 (小有名气)

3楼2011-09-23 18:51:00
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

weimei0110(金币+2): 嘻嘻 顺斜有影响吗? 2011-09-24 16:21:40
你那个PAGE胶跑得一顺斜
真相是最大的奢侈品
4楼2011-09-24 08:31:27
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

★ ★
dhd997(金币+2): 2011-09-24 18:02:24
weimei0110(金币+8): 好吧好吧 我去跑一个好的再看看,怎么才能避免顺斜呢?两遍点上loading buffer? 2011-09-25 13:16:41
一顺斜,marker 就不准了,前面的孔跑得快,后面的跑得慢,跑直了,可能就差不多了。
真相是最大的奢侈品
5楼2011-09-24 17:40:25
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