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shuihaizi

金虫 (小有名气)

[求助] pUC19-SalI单酶切,连个2500片段,连不上?

最近在做单酶切连接,怎么也连不上,请大家帮忙!
pUC19和2500bp的目的片段通过SalI单酶切,进行连接,不知道什么原因总是连不上?
本不应该难连啊?
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

★ ★
dhd997(金币+2): 鼓励热心版版 2011-09-06 07:38:23
shuihaizi(金币+2): 2011-09-06 08:59:19
载体或者目的片段去磷酸化,否则载体自连的较多,不易挑到!
真相是最大的奢侈品
2楼2011-09-05 22:09:31
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瓶儿花

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
wanhscn(金币+2): 比较准确! 2011-09-06 09:58:28
shuihaizi(金币+2): 2011-09-06 11:52:14
载体去磷酸化,不然会自连,目的片段可以不用去磷酸化的。做的时候加对照,以不加目的片段,只加酶切并去磷酸化的载体的连接液为对照,就能知道你载体去磷酸化的效果了。
3楼2011-09-06 09:53:27
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

引用回帖:
2楼: Originally posted by wanhscn at 2011-09-05 22:09:31:
载体或者目的片段去磷酸化,否则载体自连的较多,不易挑到!

表述有误,载体必须去磷酸化!
真相是最大的奢侈品
4楼2011-09-06 10:00:01
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shuihaizi

金虫 (小有名气)

你们的意思是没有去磷酸化,连上的可能性很小是吗?
另外,是不是因为我的目的片段太大啊?快和载体一样大了,不知道怎么样的连接比例较好?
5楼2011-09-06 11:51:57
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瓶儿花

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
wanhscn(金币+2): good 2011-09-06 14:13:54
shuihaizi(金币+2): 2011-09-06 16:25:18
目的片段比较大没有关系的,载体必须要去磷酸化的,因为你做的是单酶切。没有去磷酸化很容易自连。连接的反应体系不应过大。体系过大,浓度越低,分子碰撞的概率越低,这样连接的概率也就越低了。一般连接的反应体系为10μL.
载体   1μL
目的片段  7μL
10×T4 DNA ligase 1μL
T4 DNA ligase   1μL
16℃连接过夜。
注意要加好对照,这样便于你分析结果。
祝你好运!
6楼2011-09-06 12:33:28
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36894256

金虫 (小有名气)

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shuihaizi(金币+2): 2011-09-06 16:25:35
应该好连的 你连过夜后 你可以转化前跑一个核酸电泳对照一下 与你连接的东西 之后再用 xl10-gold菌转化 指定能连上的
7楼2011-09-06 13:30:17
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hjpcy

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
shuihaizi(金币+3): 2011-09-06 16:26:05
西瓜(金币+5): Good 2011-09-06 17:25:33
1.如果是用T4连接酶,按20ul体系:
载体   100ng
目的片段  500-1000ng
10×T4 DNA ligase 2μL
T4 DNA ligase   1μL
25℃连接30min。
片段不需去磷
2.如果用快速克隆酶(该方法阳性率很高)
载体   100ng
目的片段  100-300ng
10×快速克隆酶buffer 2μL
快速克隆酶 2μL
25℃连接30min。
片段不需去磷

本人构建过二十多个克隆,90%一次性成功
8楼2011-09-06 14:15:23
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shuihaizi

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 36894256 at 2011-09-06 13:30:17:
应该好连的 你连过夜后 你可以转化前跑一个核酸电泳对照一下 与你连接的东西 之后再用 xl10-gold菌转化 指定能连上的

我用的事Takara的T4连接酶,25度30分钟行吗?谢谢
9楼2011-09-06 16:27:38
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shuihaizi

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by shuihaizi at 2011-09-06 11:51:57:
你们的意思是没有去磷酸化,连上的可能性很小是吗?
另外,是不是因为我的目的片段太大啊?快和载体一样大了,不知道怎么样的连接比例较好?

能推荐个去磷酸化的体系及用到的试剂吗(哪个公司的什么酶,什么体系?)我之前做克隆一直没有去磷酸化。谢谢
10楼2011-09-06 16:29:26
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