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piaoyuaaa金虫 (小有名气)
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克隆测序的问题
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| DGGE回收胶测序，我送公司的三个样品，编号分别为5，6，8，是跑胶中最亮的三条带，割胶回收后用不带夹子的引物做了PCR，琼脂糖电泳检测出来了两条带（理论上应该是一条特异性条带），位置分别约为250bp和230bp，当时觉得是样品不纯，V3区引物扩出来大约在230bp,所以让公司割胶回收纯化了230bp的条带进行克隆测序，测序结果5-230bp的是无色杆菌属，6-230bp的是紫色杆菌属，8-230bp的是假单胞菌属，因为测序结果出来后看到序列长度仅为197bp，所以就想看看250bp的那条带到底是什么东西，之后就测了5号样品的250bp的那条带，今天出来结果序列长度仍旧为197bp，BLAST后5-250bp的是希瓦氏菌属，所以现在不知道该怎么办，实验室还有8个样品没有送公司去测，每个样品都有两条带，是测230bp那条还是测250bp那条？请问虫友有没有遇到过这样的问题，到底怎么回事？谢谢！ |
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piaoyuaaa
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piaoyuaaa(金币+5): 2011-10-13 09:58:10
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4楼2011-08-09 20:21:43
