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billy8580

新虫 (初入文坛)

[求助] 请教real time pcr问题,谢谢!

各位大虾们,小弟想咨询一些荧光定量的问题,如下:
1. RNA提取后,必须要测浓度吗,要根据浓度来决定加入多少ul的rna吗?
2. 假如cDNA中还有DNA污染,该怎么办?能在cDNA中加入DNAseI除去DNA吗,这回切割cDNA吗?
3. 我的模板稀释了四个梯度(5,25,125,625)选用18s做内参,结果CT值很大,都在30以上,后来调整了预变性时间,从5min增加到10min,CT值降为24左右,但是这对于内参基因来讲,仍然很大。我的目的基因CT值都在32-33以上。请问这是怎么回事?我的RNA用盒子提的,效果不错。反转录用的promega的m-mlv,用ologodt15(50uM)做引物。
4. 我有个同学做逆境,相同稀释倍数时,干旱处理时内参18S的CT在10左右,但做盐胁迫时相同18S的CT值竟然都在25左右,后来测了一下模板浓度, 都在1000-1300ng左右,感觉差不多呀,听一个师姐说做不同的逆境,可能需要不同的引物,请问这是怎么回事呢?

小弟最近一直很迷茫,不敢轻易再上ABI7500去尝试了,因为材料有限,模板有限,不敢轻易得瑟模板。请各位大虾给予解答!谢谢!
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浮生、若梦

金虫 (小有名气)

十分感谢西瓜斑竹,学到不少东西!
坚持自我
10楼2013-05-03 11:55:16
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