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Hannet

金虫 (正式写手)

[交流] 真菌(青霉)纯化问题 已有6人参与

我有一株真菌,通过ITS比对,是青霉,但在PDA生长很慢,而且只长孢子,所以纯化很麻烦,我纯得一株。接种菌块,在试管里培养得打孢子种子液,用孢子液涂布平板,长出来的菌落,在同一个平板上,开始都是一样的白色菌落,培养一段时间,原本一样的菌落表现出有不同的菌落特征,分别挑起不同菌落培养,提取DNA,扩ITS,测序比对,原来在同一块平板上的不同菌落菌,测序结果,比对后同源性很高,应该是同一株菌。
有没有人遇到这样类似的情况?
照片在下;
不同菌落照片改天补上;

补上两个不同菌落图片,两个菌ITS序列同源性很高95%,从20-510的碱基序列全部相同。





[ Last edited by Hannet on 2011-6-30 at 11:56 ]
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冼亮淀粉酶

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生物大分子降解酶


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
楼主,你这三种菌落形态我都有,很可惜,它们是不同的菌。你也分析过ITS了,我认为如果是用同一种菌再分离得到的青霉,它们的ITS起码是99%相同,剩下的1%是测序产生的误差,也就是说应该是完全相同的。
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
7楼2011-08-11 20:10:18
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
在同一种培养基的平板上形态不同,就表示各自基因间有差别,所以就不能称为同一株菌株。但是可能为同一种,因为分类学上种下面还有亚种和变种。
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9楼2011-08-12 01:22:09
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冼亮淀粉酶

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生物大分子降解酶

★ ★ ★ ★
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scelab(金币+3): 谢谢交流 2011-08-13 00:19:11
ITS鉴定是存在争议的,既然菌落形态不同,那么仅凭某一个片段的DNA可能也难以表现出足够的差异,或许要更多的鉴定方式。你的这个实验是不是一定要鉴定清楚这三个菌株的种?因为往后鉴定可能要花更多的钱。
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11楼2011-08-12 20:14:58
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冼亮淀粉酶

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生物大分子降解酶


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
12楼: Originally posted by ganchao1776 at 2011-08-18 00:00:00:
可能不是亚种变种的问题,只是简单的平板营养的问题,比如说大的菌落的地方营养就贫乏,引起霉菌的形态就会略有不同。它们基因组间是没有区别的,但是活跃的基因有差别
[ Last edited by ganchao1776 on ...

你遇到过这样的事情?能不能放照片出来让大家学习一下?
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13楼2011-08-18 00:10:48
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