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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 真菌（青霉）纯化问题
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Hannet

金虫 (正式写手)

[交流] 真菌（青霉）纯化问题 已有6人参与

我有一株真菌，通过ITS比对，是青霉，但在PDA生长很慢，而且只长孢子，所以纯化很麻烦，我纯得一株。接种菌块，在试管里培养得打孢子种子液，用孢子液涂布平板，长出来的菌落，在同一个平板上，开始都是一样的白色菌落，培养一段时间，原本一样的菌落表现出有不同的菌落特征，分别挑起不同菌落培养，提取DNA，扩ITS，测序比对，原来在同一块平板上的不同菌落菌，测序结果，比对后同源性很高，应该是同一株菌。
有没有人遇到这样类似的情况？
照片在下；
不同菌落照片改天补上；

补上两个不同菌落图片，两个菌ITS序列同源性很高95%，从20-510的碱基序列全部相同。





[ Last edited by Hannet on 2011-6-30 at 11:56 ]
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1楼 2011-06-29 21:51:52
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
★
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楼主，你这三种菌落形态我都有，很可惜，它们是不同的菌。你也分析过ITS了，我认为如果是用同一种菌再分离得到的青霉，它们的ITS起码是99%相同，剩下的1%是测序产生的误差，也就是说应该是完全相同的。
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流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
7楼2011-08-11 20:10:18
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冼亮淀粉酶

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生物大分子降解酶
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在同一种培养基的平板上形态不同，就表示各自基因间有差别，所以就不能称为同一株菌株。但是可能为同一种，因为分类学上种下面还有亚种和变种。
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9楼2011-08-12 01:22:09
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冼亮淀粉酶

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生物大分子降解酶
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scelab(金币+3): 谢谢交流 2011-08-13 00:19:11
ITS鉴定是存在争议的，既然菌落形态不同，那么仅凭某一个片段的DNA可能也难以表现出足够的差异，或许要更多的鉴定方式。你的这个实验是不是一定要鉴定清楚这三个菌株的种？因为往后鉴定可能要花更多的钱。
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11楼2011-08-12 20:14:58
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冼亮淀粉酶

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引用回帖:
12楼: Originally posted by ganchao1776 at 2011-08-18 00:00:00:
可能不是亚种变种的问题，只是简单的平板营养的问题，比如说大的菌落的地方营养就贫乏，引起霉菌的形态就会略有不同。它们基因组间是没有区别的，但是活跃的基因有差别
[ Last edited by ganchao1776 on ...

你遇到过这样的事情？能不能放照片出来让大家学习一下？
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13楼2011-08-18 00:10:48
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