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Hannet

金虫 (正式写手)

[交流] 真菌(青霉)纯化问题已有6人参与

我有一株真菌,通过ITS比对,是青霉,但在PDA生长很慢,而且只长孢子,所以纯化很麻烦,我纯得一株。接种菌块,在试管里培养得打孢子种子液,用孢子液涂布平板,长出来的菌落,在同一个平板上,开始都是一样的白色菌落,培养一段时间,原本一样的菌落表现出有不同的菌落特征,分别挑起不同菌落培养,提取DNA,扩ITS,测序比对,原来在同一块平板上的不同菌落菌,测序结果,比对后同源性很高,应该是同一株菌。
有没有人遇到这样类似的情况?
照片在下;
不同菌落照片改天补上;

补上两个不同菌落图片,两个菌ITS序列同源性很高95%,从20-510的碱基序列全部相同。





[ Last edited by Hannet on 2011-6-30 at 11:56 ]
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Hannet

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by microxy at 2011-06-30 07:23:42:
另外根据你的培养基的表型,感觉你用的是成品的PDA或者是用的土豆淀粉,根据我们的经验,好像利用土豆直接煮沸,过滤 配制出来的培养基更利于真菌生长。

我们实验室也是用自己煮的土豆配制的PDA
4楼2011-06-30 11:02:13
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金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2011-08-11 20:10:18:
楼主,你这三种菌落形态我都有,很可惜,它们是不同的菌。你也分析过ITS了,我认为如果是用同一种菌再分离得到的青霉,它们的ITS起码是99%相同,剩下的1%是测序产生的误差,也就是说应该是完全相同的。

哦,那我要怎么鉴别这三株菌是不是同一株菌呢?
8楼2011-08-11 21:29:34
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金虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2011-08-12 01:22:09:
在同一种培养基的平板上形态不同,就表示各自基因间有差别,所以就不能称为同一株菌株。但是可能为同一种,因为分类学上种下面还有亚种和变种。

怪不得我测他们的ITS(500bp)几乎一样,那有没有什么分子手段区分鉴别他们?
10楼2011-08-12 14:25:42
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