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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】这种情况下如何做荧光定量啊
汕头大学海洋科学接受调剂
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511594234

金虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】这种情况下如何做荧光定量啊

求助，目前手上有一个基因的两个亚型，开放阅读框的序列相似性很高，设计引物做荧光定量，pcr产物测序后有非特异性扩增，无法区分开这两个亚型。想请教高手这种情况下如何做定量。
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1楼 2011-03-31 21:35:07
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65900931

银虫 (小有名气)
★
511594234(金币+3):谢谢参与
511594234(金币+5): 谢谢，反转录的cDNA为模板。 2011-04-01 09:24:53
看天(EPI+1): 专业指数 2011-04-01 13:49:38
不知道你是要做DNA定量还是反转录。如果是做反转录，序列同源性有多高？可以找到序列不同的地方设计PCR引物吗？
如果不行，应该可以找到一段13bp左右的序列明显差异的区域吧。设计一条引物macth这段区域，做特异引物的逆转录，然后在之前设计一对引物做real-time PCR应该就行了。
DNA的话可以考虑做探针。

[ Last edited by 65900931 on 2011-4-1 at 00:41 ]
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2楼2011-03-31 23:27:10
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六妖妖

金虫 (正式写手)
★
511594234(金币+3):谢谢参与
同源性太强还是做探针比较好分辨。
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3楼2011-04-06 11:55:01
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forrestgump

新虫 (著名写手)
★
511594234(金币+3):谢谢参与
同源性太强还是做探针比较好分辨。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-04-06 12:11:39
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gl185

铜虫 (正式写手)
★
511594234(金币+3):谢谢参与
好东西
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5楼2011-04-06 12:19:54
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