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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】AUTODOCK 产生的氢键原理~

在AUTODOCK 4.0做对接，对接完成后看蛋白与配体相互作用的时候，有一个氢键形成，是蛋白中的一个蛋氨酸上的-S-与配体中的-O-形成氢键该O 上没有氢，两边连的是C

查看TXT文本，该S原子的类型为 SD ，也就是S是氢键给体

AUTODOCK里定义的是S是氢键给体，O是氢键受体。对于这个H键，显而易见，O是氢键受体，但是S是如何成为氢键给体的呢？它的两个键也是接的是C

求助解释下，S与O是如何形成氢键的？

[ Last edited by 绿茶QJM on 2011-3-30 at 13:38 ]

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1楼 2011-03-29 18:11:43

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chemozhang

木虫 (正式写手)

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6楼2011-09-05 19:36:36

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hhwinhuanghe

木虫 (小有名气)

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★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-03-30 12:48:54
绿茶QJM(金币+1): 2011-03-30 13:38:38

引用回帖:

Originally posted by 绿茶QJM at 2011-03-29 18:11:43:
在AUTODOCK 4.0做对接，对接完成后看蛋白与配体相互作用的时候，有一个氢键形成，是蛋白中的一个蛋氨酸上的-S-与配体中的-O-形成氢键

查看TXT文本，该S原子的类型为 SD

求助解释下，S与O是如何形成氢键 ...

如果氧上有氢就可以

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2楼2011-03-30 06:24:02

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