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hitliutao

银虫 (小有名气)

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[交流] 【求助/交流】请问DGGE条带测序后如何绘制系统发育图

DGGE条带已测序，并进行了BLAST对比，请问各位高手，如何才能绘制这样的树形图呢，尤其是后面用中括号勾出了具体的division，用MEGA么？

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1楼 2011-03-25 10:09:56

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hitliutao

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自己顶起

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2楼2011-03-25 15:35:34

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xiadongliang

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mega就可以。

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3楼2011-03-25 17:17:58

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tsingtao2008

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3楼正解

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4楼2011-03-26 08:12:58

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haitian0625

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hitliutao(金币+2): 2011-03-30 10:02:41

对啊，用MEGA就行，前期数据可用Clustal、Bioedit处理下，生成fsata格式文件。

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5楼2011-03-26 10:12:17

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hitliutao

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Originally posted by tsingtao2008 at 2011-03-26 08:12:58:
3楼正解

请问图右侧那些用竖线勾出来的微生物lineage，用MEGA也可以做么，怎么做啊，刚才研究了半天也没研究明白

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6楼2011-03-30 10:05:40

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hitliutao

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Originally posted by haitian0625 at 2011-03-26 10:12:17:
对啊，用MEGA就行，前期数据可用Clustal、Bioedit处理下，生成fsata格式文件。

我只会做左侧那样的图，图右侧那些用竖线勾出来的微生物lineage，用MEGA怎么做啊

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7楼2011-03-30 10:08:25

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haitian0625

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这个我还没用到呢，我现在只是初期大概看一下，后面也不一定用到。你可以自己找一下啊，找完了别忘分享啊。

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8楼2011-03-31 08:50:34

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hitliutao

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自己顶起来啊

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9楼2011-03-31 10:02:17

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xiadongliang

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★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流

mega就可以得到右侧那个竖道道和细菌分类单元

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10楼2011-04-01 17:29:01

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warrrraw

禁虫 (小有名气)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流

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11楼2011-04-02 15:31:23

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hitliutao

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引用回帖:

Originally posted by xiadongliang at 2011-04-01 17:29:01:
mega就可以得到右侧那个竖道道和细菌分类单元

请问那个竖道道应该怎么用MEGA绘制啊,我研究半天也没研究明白

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12楼2011-04-22 20:44:33

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hitliutao

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引用回帖:

Originally posted by warrrraw at 2011-04-02 15:31:23:
我是先用CLUSTALX比对，然后再MEGA中构建，在MEGA的工具栏里有竖杠及分类的生成

请问竖杠及分类的生成，在工具栏里的哪个位置啊，我研究半天也不明白，望赐教，不胜感谢！

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13楼2011-04-22 20:48:23

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在雨中

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竖杠自己在PPT里慢慢编辑，文字自己加，别老指望着软件给你做的玩玩美美。

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14楼2013-03-16 08:36:20

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在雨中

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撸主做的是环境样品硝化功能amoA基因的？还是16S的？
偶的一篇文章正在写这个。

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15楼2013-03-16 08:37:26

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