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hitliutao

银虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】请问DGGE条带测序后如何绘制系统发育图

DGGE条带已测序,并进行了BLAST对比,请问各位高手,如何才能绘制这样的树形图呢,尤其是后面用中括号勾出了具体的division,用MEGA么?
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hitliutao

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by tsingtao2008 at 2011-03-26 08:12:58:
3楼正解

请问图右侧那些用竖线勾出来的微生物lineage,用MEGA也可以做么,怎么做啊,刚才研究了半天也没研究明白
6楼2011-03-30 10:05:40
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haitian0625

金虫 (小有名气)


hitliutao(金币+2): 2011-03-30 10:02:41
对啊,用MEGA就行,前期数据可用Clustal、Bioedit处理下,生成fsata格式文件。
5楼2011-03-26 10:12:17
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hitliutao

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by haitian0625 at 2011-03-26 10:12:17:
对啊,用MEGA就行,前期数据可用Clustal、Bioedit处理下,生成fsata格式文件。

我只会做左侧那样的图,图右侧那些用竖线勾出来的微生物lineage,用MEGA怎么做啊
7楼2011-03-30 10:08:25
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haitian0625

金虫 (小有名气)


这个我还没用到呢,我现在只是初期大概看一下,后面也不一定用到。你可以自己找一下啊,找完了别忘分享啊。
8楼2011-03-31 08:50:34
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