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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】请问DGGE条带测序后如何绘制系统发育图
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hitliutao

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】请问DGGE条带测序后如何绘制系统发育图

DGGE条带已测序，并进行了BLAST对比，请问各位高手，如何才能绘制这样的树形图呢，尤其是后面用中括号勾出了具体的division，用MEGA么？
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1楼 2011-03-25 10:09:56
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在雨中

金虫 (著名写手)
撸主做的是环境样品硝化功能amoA基因的？还是16S的？
偶的一篇文章正在写这个。
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15楼2013-03-16 08:37:26
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haitian0625

金虫 (小有名气)
hitliutao(金币+2): 2011-03-30 10:02:41
对啊，用MEGA就行，前期数据可用Clustal、Bioedit处理下，生成fsata格式文件。
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5楼2011-03-26 10:12:17
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hitliutao

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by tsingtao2008 at 2011-03-26 08:12:58:
3楼正解

请问图右侧那些用竖线勾出来的微生物lineage，用MEGA也可以做么，怎么做啊，刚才研究了半天也没研究明白
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6楼2011-03-30 10:05:40
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hitliutao

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by haitian0625 at 2011-03-26 10:12:17:
对啊，用MEGA就行，前期数据可用Clustal、Bioedit处理下，生成fsata格式文件。

我只会做左侧那样的图，图右侧那些用竖线勾出来的微生物lineage，用MEGA怎么做啊
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7楼2011-03-30 10:08:25
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