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【求助/交流】如何调取未知基因
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huangdi07
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[交流]
【求助/交流】如何调取未知基因
我有个真菌类微生物,想做基因敲除,但是没有该菌株的基因序列,只是推测有相关途径(该途径在蓝细菌里存在),想问一下大家,如何克隆出这段未知基因?非常焦急!
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1楼
2011-03-23 20:29:55
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zhengfan1109
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huangdi07(金币+1): 2011-03-23 22:37:18
既然有了可能相关的序列,那可以先根据已经有的序列设计引物,尝试调出基因,再测序。
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2楼
2011-03-23 22:26:26
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Originally posted by
zhengfan1109
at 2011-03-23 22:26:26:
既然有了可能相关的序列,那可以先根据已经有的序列设计引物,尝试调出基因,再测序。
现在的情况是,只有蓝细菌里有这段序列,真菌属于真核生物,是不是设计引物时考虑密码子简并性问题啊?另外,做race能实现吗?
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2011-03-23 22:39:39
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huangdi07(金币+1): 2011-03-24 08:05:26
不知道序列,知道功能的话也可以
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2011-03-23 22:40:59
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huangdi07
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Originally posted by
gongeleven
at 2011-03-23 22:40:59:
不知道序列,知道功能的话也可以
如何设计引物啊?两个菌一个真核的一个原核的,差异很大啊
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2011-03-24 08:06:27
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silicare(金币+2): 谢谢参与 2011-03-24 12:49:39
huangdi07(金币+1): 谢谢 2011-03-25 11:17:40
可以参考一下蓝细菌的基因序列
做一短点的引物然后做一下BLAST验证后优化引物做一下PCR试试了
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2011-03-24 10:33:17
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蛋白的活性中心是保守的,寻找该蛋白的保守序列设计兼并引物
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7楼
2012-03-18 21:25:21
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shaquila
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★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
用先搜索est做电子克隆,然后设计兼并引物或高同源区域设计引物啊。其实这就是最基本的同源克隆,搜索下很多的,书上也有相关知识。
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8楼
2012-03-18 22:37:23
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