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chengrui

金虫 (小有名气)

[求助] 如何克隆一种未知菌的葡聚糖酶基因

我筛选到了一株能降解beta葡聚糖的细菌，通过16srDNA测序已经大致确定其种属，现在希望能将其葡聚糖酶基因克隆出来，打算根据该种属的葡聚糖酶基因的高保守序列设计引物进行PCR扩增，但不知该怎么寻找保守序列，急需有经验者的帮忙，谢谢！答案要尽量详细哦
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1楼 2010-08-26 18:55:26
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kingze-van

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

貌似沙发！这个本科学过基础，现在还了，不做这方面的了！
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爱，你必须专一。爱是一种了解；爱是一种付出；爱是一种陶醉；爱是一种承诺；爱是一种理想。
2楼2010-08-26 19:17:53
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hxq320

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

可以在NCBI找出已经发表的其他细菌的葡聚糖酶基因，根据保守序列设计引物PCR或者做RACE
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3楼2010-08-26 20:04:53
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chengrui

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by hxq320 at 2010-08-26 20:04:53:
可以在NCBI找出已经发表的其他细菌的葡聚糖酶基因，根据保守序列设计引物PCR或者做RACE

我就是不知道该如何确定保守序列，有专门的软件吗，希望能有详细的解答，谢谢！
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4楼2010-08-26 20:32:01
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hxq320

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

有呀，多找几其他细菌的基因做序列比对
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5楼2010-08-26 21:03:11
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chengrui

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by hxq320 at 2010-08-26 21:03:11:
有呀，多找几其他细菌的基因做序列比对

我用lasergene里的megalin做了比对，怎么确定高保守序列呢
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6楼2010-08-26 21:35:40
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kether

新虫 (小有名气)
引用回帖:
1924617楼: Originally posted by hxq320 at 2010-08-26 20:04:53:
可以在NCBI找出已经发表的其他细菌的葡聚糖酶基因，根据保守序列设计引物PCR或者做RACE

细菌是原核生物也能做RACE？
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7楼2012-03-16 11:10:50
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