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chengrui

金虫 (小有名气)

[求助] 如何克隆一种未知菌的葡聚糖酶基因

我筛选到了一株能降解beta葡聚糖的细菌,通过16srDNA测序已经大致确定其种属,现在希望能将其葡聚糖酶基因克隆出来,打算根据该种属的葡聚糖酶基因的高保守序列设计引物进行PCR扩增,但不知该怎么寻找保守序列,急需有经验者的帮忙,谢谢!答案要尽量详细哦

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kingze-van

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

貌似沙发!这个本科学过基础,现在还了,不做这方面的了!
爱,你必须专一。爱是一种了解;爱是一种付出;爱是一种陶醉;爱是一种承诺;爱是一种理想。
2楼2010-08-26 19:17:53
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hxq320

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

可以在NCBI找出已经发表的其他细菌的葡聚糖酶基因,根据保守序列设计引物PCR或者做RACE
3楼2010-08-26 20:04:53
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chengrui

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by hxq320 at 2010-08-26 20:04:53:
可以在NCBI找出已经发表的其他细菌的葡聚糖酶基因,根据保守序列设计引物PCR或者做RACE

我就是不知道该如何确定保守序列,有专门的软件吗,希望能有详细的解答,谢谢!
4楼2010-08-26 20:32:01
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hxq320

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

有呀,多找几其他细菌的基因做序列比对
5楼2010-08-26 21:03:11
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chengrui

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by hxq320 at 2010-08-26 21:03:11:
有呀,多找几其他细菌的基因做序列比对

我用lasergene里的megalin做了比对,怎么确定高保守序列呢
6楼2010-08-26 21:35:40
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kether

新虫 (小有名气)

引用回帖:
1924617楼: Originally posted by hxq320 at 2010-08-26 20:04:53:
可以在NCBI找出已经发表的其他细菌的葡聚糖酶基因,根据保守序列设计引物PCR或者做RACE

细菌是原核生物也能做RACE?
7楼2012-03-16 11:10:50
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