24小时热门版块排行榜    

查看: 2306  |  回复: 10

aaron2012

银虫 (初入文坛)


[交流] 【求助/交流】求富含GC的片段的PCR条件

各位大侠,不知道各位在做富含GC片段的时候有没有什么心得,比较好的PCR条件。其他还需要注意的事项。希望得到大家的帮助。谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bijing_1111

新虫 (初入文坛)



aaron2012(金币+3): 2011-03-10 15:49:40
最爱花诗雨(金币+1): 鼓励新虫交流~~ 2011-03-10 17:12:33
做过GC含量70%多的片段扩增,用了GC Buffer(好像是TAKARA的),参照说明书的条件,体系没有什么特别,主要是变性时间不要太长,一分钟就够了,GC Buffer裂解能力很强,循环中10s变性就够了。酶根据你的片段要求选择,没要求普通tag酶就ok。
2楼2011-03-10 15:14:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

101202139

铜虫 (小有名气)


aaron2012(金币+1): 2011-03-10 15:49:31
最好加入5%-10%的DMSO(二甲基亚砜)
3楼2011-03-10 15:40:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aaron2012

银虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by bijing_1111 at 2011-03-10 15:14:24:
做过GC含量70%多的片段扩增,用了GC Buffer(好像是TAKARA的),参照说明书的条件,体系没有什么特别,主要是变性时间不要太长,一分钟就够了,GC Buffer裂解能力很强,循环中10s变性就够了。酶根据你的片段要求选 ...

你说的变性时间是指最开始的那个变性时间,还是循环里的变形时间?
我这阵子也有10×GCEnhencer。你们在做的时候一般加多少啊?
4楼2011-03-10 15:48:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aaron2012

银虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by 101202139 at 2011-03-10 15:40:31:
最好加入5%-10%的DMSO(二甲基亚砜)

看有关文献   说退火温度对其影响也很大   今天有加DMSO还是没有带出来
5楼2011-03-10 15:49:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yabxxh

木虫 (正式写手)


★ ★
aaron2012(金币+3): 2011-03-10 16:26:30
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流。 2011-03-10 19:34:59
呵呵,我是克隆过一段人的基因,GC含量非常高,用的是TAKARA的primerstar hs热启动版,gc buffer II,注意片段长度,退火10s足够,应该不是很难得到。真不行前面加一段60度得降落PCR(约5个循环),后面TM值扩增。好运
6楼2011-03-10 15:50:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aaron2012

银虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by yabxxh at 2011-03-10 15:50:55:
呵呵,我是克隆过一段人的基因,GC含量非常高,用的是TAKARA的primerstar hs热启动版,gc buffer II,注意片段长度,退火10s足够,应该不是很难得到。真不行前面加一段60度得降落PCR(约5个循环),后面TM值扩增。 ...

请问你用的简并引物  还是特异引物啊     能不能把你具体的PCR条件告诉我一下  谢谢
7楼2011-03-10 16:26:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bijing_1111

新虫 (初入文坛)


aaron2012(金币+1): 2011-03-12 08:32:30
aaron2012(金币+1): 2011-03-12 08:35:06
引用回帖:
Originally posted by aaron2012 at 2011-03-10 15:48:15:
你说的变性时间是指最开始的那个变性时间,还是循环里的变形时间?
我这阵子也有10×GCEnhencer。你们在做的时候一般加多少啊?

预变性1min,循环中10s。Buffer终浓度都是1×的,我用过的GC Buffer是2×GC Buffer 2,好像是TAKARA的。
8楼2011-03-11 09:27:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yabxxh

木虫 (正式写手)


aaron2012(金币+1): 2011-03-12 08:35:14
引用回帖:
Originally posted by yabxxh at 2011-03-10 15:50:55:
呵呵,我是克隆过一段人的基因,GC含量非常高,用的是TAKARA的primerstar hs热启动版,gc buffer II,注意片段长度,退火10s足够,应该不是很难得到。真不行前面加一段60度得降落PCR(约5个循环),后面TM值扩增。 ...

呵呵,我用的是PCR特异引物,你要用兼并引物的话,要注意Tm算法。我的条件不一定适合你的,就是普通的两步法,在第一步后面加上一步95度1min,效果可能会好点,goodluck
9楼2011-03-11 09:53:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wqj1988926

金虫 (正式写手)


10楼2011-03-11 11:23:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fywjp

木虫 (正式写手)


相关文献有很多,去年AC就有一篇啊,上网查一下就行了
11楼2011-03-11 14:18:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 aaron2012 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 04:06 by gy1nBQXYQJqL
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-29 00:28 by winsaint
[基金申请] 国自然评审意见 +11 wangmingqi 2026-08-28 15/750 2026-08-29 00:17 by fangyl2005
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +13 晴天加油 2026-08-26 14/700 2026-08-28 18:36 by huagongfeihu
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +3 bud_bud 2026-08-27 6/300 2026-08-28 11:53 by bud_bud
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
请填处理意见