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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)


[交流] 【求助】MS如何实现水分子与SiO2反应的分子动力学模拟过程(想得到Si-OH键)?

1、MS Discover或Forcite模块(其它模块也可以)如何实现水分子(H2O)与SiO2反应的分子动力学过程(想得到Si-OH键)?如何放置水分子到SiO2表面?
参考MS tutorial,直接把水分子粘贴放置到SiO2表面,但是Discover Dynamic后观察轨迹文件,没有任何水分子要与SiO2反应的迹象,没有形成Si-OH。
2、MS中如何实现将两片SiO2放置到一起?已使用方法:使用MS Build —> Build layer来将第一层放SiO2、第二层也放SiO2。但是用Discover模拟,查看轨迹文件没有任何形成Si-O-Si键的过程。
3、MS中把晶体形态的SiO2高温退火后得到的是否是非晶态的SiO2?如何实现高温退火处理,用的Forcite anneal是否可以做到?
以上三个问题困扰小弟很久了,希望前辈们指点,十分感谢!
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syongui

金虫 (正式写手)


★ ★
wzbhit(金币+2):谢谢参与
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-03-01 15:55:54
SiO2与H2O反应,首先你要确定水分子在前者表面的吸附状态,建立合似模型,估计你的模型建立的有问题!!
8楼2011-03-01 15:45:31
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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)


不知道自己算不算是合格的菜鸟。是我的问题太简单,还是我没有把问题说清楚?希望大家可以关于我的问题 讨论一下 给我指点一下问题解决的方向,大致说一下我该向从何处入手。小弟将十分感激!
2楼2011-02-24 15:10:00
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★ ★
wzbhit(金币+2):谢谢参与
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-02-25 14:38:04
wzbhit(金币+5): 2011-02-25 20:23:32
力场方法包括了化学键断裂和生成吗?
3楼2011-02-25 12:16:24
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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2011-02-25 12:16:24:
力场方法包括了化学键断裂和生成吗?

我用的Material Studio自带的COMMPASS力场模拟的,我不懂您说的是否包含化学键的断裂和生成。 我想做的是模拟玻璃的键合过程。
我想请问您:MS有办法模拟退火么?是Forcite模块里的那个Annealing吗?
4楼2011-02-25 20:22:19
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