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【求助】MS如何实现水分子与SiO2反应的分子动力学模拟过程（想得到Si-OH键）？
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1、MS Discover或Forcite模块（其它模块也可以）如何实现水分子（H2O）与SiO2反应的分子动力学过程（想得到Si-OH键）？如何放置水分子到SiO2表面？ 参考MS tutorial，直接把水分子粘贴放置到SiO2表面，但是Discover Dynamic后观察轨迹文件，没有任何水分子要与SiO2反应的迹象，没有形成Si-OH。 2、MS中如何实现将两片SiO2放置到一起？已使用方法：使用MS Build —> Build layer来将第一层放SiO2、第二层也放SiO2。但是用Discover模拟，查看轨迹文件没有任何形成Si-O-Si键的过程。 3、MS中把晶体形态的SiO2高温退火后得到的是否是非晶态的SiO2？如何实现高温退火处理，用的Forcite anneal是否可以做到？ 以上三个问题困扰小弟很久了，希望前辈们指点，十分感谢！ |
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wzbhit(金币+2):谢谢参与
zzy870720z(金币+2): 谢谢参与讨论 2011-02-26 14:11:51
wzbhit(金币+5): 2011-02-26 15:20:18
wzbhit(金币+2):谢谢参与
zzy870720z(金币+2): 谢谢参与讨论 2011-02-26 14:11:51
wzbhit(金币+5): 2011-02-26 15:20:18
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discover和forcite都是经典分子动力学，选用的力场或者叫做经验势进行的模拟，而这样的势函数有很大的局限性，不同的模型是不一定适用的。 建议：1以前是否有人采用经典分子动力学方法模拟过相同或者相似的反应，如果有，就用它用过的力场。或者采用量子分子动力学CPMD用赝势，模拟这个过程；个人认为键不是图上显示有就有，显示无就无 2同上，力场可能不合适 3额 这个没用过 不知道 |
6楼2011-02-26 13:04:32
2楼2011-02-24 15:10:00
3楼2011-02-25 12:16:24
4楼2011-02-25 20:22:19
