应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】如何对PCR测序产物进行分析？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
121/2返回列表12下一页
查看: 2837  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

350784478

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】如何对PCR测序产物进行分析？ 已有8人参与

最近在做某一基因的RT-PCR反应，取得了进展。产物送去测序，已将测序结果发给我了，但是我不知道如何从测序峰图中看出是否有突变?
我晓得最简单的办法就是对碱基序列进行对照，但是由于碱基数较多，，所以操作起来比较麻烦，不知道是否有较简单的方法？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
朝为田舍郎，暮登天子堂。将相本无种，男儿当自强。
1楼 2011-01-29 14:44:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
dhd997(金币+2): good 2011-01-30 18:59:24
用软件进行比对啊
经典的bioedit到什么dnaman之类的都可以
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2011-01-29 17:58:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

phoenix211

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
dhd997(金币+2): 谢谢交流 2011-01-30 19:00:33
用软件做就好了啊，我一般用DNAMAN和Clustal Raindy。非常方便。
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2011-01-29 23:41:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guoxingjun2008

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
dhd997(金币+3): good 2011-01-30 19:00:57
对头，但是不知道你是不是双向测序，如果是双向测序的话要用拼接软件拼接后再比对。
   另外我提醒一下你，不知道你PCR的时候用的普通Taq酶还是高保真Taq酶，如果是普通Taq酶的话，看突变是不科学的，因为普通Taq酶保真性不好，有渗入错误碱基的可能，所以最好是用Pfu！
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2011-01-30 14:49:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

350784478

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by guoxingjun2008 at 2011-01-30 14:49:01:
对头，但是不知道你是不是双向测序，如果是双向测序的话要用拼接软件拼接后再比对。
   另外我提醒一下你，不知道你PCR的时候用的普通Taq酶还是高保真Taq酶，如果是普通Taq酶的话，看突变是不科学的，因为普通Ta ...

你好！我是单向的，且不是用高保真的Taq酶。我的目的产物是1060bp，但是测出来才990bp，我对了半天，也没有发现测序结果和我的基因序列结合。郁闷！
赞一下 回复此楼
朝为田舍郎，暮登天子堂。将相本无种，男儿当自强。
5楼2011-01-30 20:55:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

350784478

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by phoenix211 at 2011-01-29 23:41:22:
用软件做就好了啊，我一般用DNAMAN和Clustal Raindy。非常方便。

你好！我是第一次做这个，我还想多问一下，我可以用这个软件来找测序结果与所做基因的同源性吗？即可以用这个软件来找测序结果在基因中的位置吗？
如果可以，如何操作呢？
赞一下 回复此楼
朝为田舍郎，暮登天子堂。将相本无种，男儿当自强。
6楼2011-01-30 21:10:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

phoenix211

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 350784478 at 2011-01-30 20:55:31:

你好！我是单向的，且不是用高保真的Taq酶。我的目的产物是1060bp，但是测出来才990bp，我对了半天，也没有发现测序结果和我的基因序列结合。郁闷！

有时候你得把测序得到的序列转换下，换成互补序列、反向序列还有反向互补序列来比对下。
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2011-01-31 23:20:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pop_hjx_41

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
不知道你是在哪里测得还是自己测得 我送到华大测序 感觉如果是900左右的话 单向测序可能后面的就很不准了 如果不结合的话 是不是p出的是非特异性结合呢？
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2011-02-03 22:37:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guoxingjun2008

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 350784478 at 2011-01-30 20:55:31:

你好！我是单向的，且不是用高保真的Taq酶。我的目的产物是1060bp，但是测出来才990bp，我对了半天，也没有发现测序结果和我的基因序列结合。郁闷！

1060bp比较长了，单向肯定是不准的，建议用双向拼接后会准确很多，同时用高保真酶，完了再加A反应，之后就可以连接T载体，这样测序既准确也能保证不会人为渗入突变碱基。  
    同时，如果和原序列比对不上的话，可以把拼接的序列弄成反向或者是反向互补再比对！
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2011-02-10 09:42:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caicai6014

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
blast ,在网站上可以直接比对，需要的话我发个说明给你
赞一下(1人) 回复此楼
caicai6014
10楼2011-02-10 11:49:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 350784478 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 284求调剂 +9 小熊～～ 2026-03-31 9/450 2026-03-31 18:22 by 253863592
[考研] 085600 一志愿9 总分351 求调剂学校 +6 czhcz 2026-03-31 6/300 2026-03-31 18:15 by 无际的草原
[考研] 求调剂 生物学 377分 +6 zzll03 2026-03-31 6/300 2026-03-31 17:33 by 唐沐儿
[考研] 080500-315分复试调剂 +9 上岸3821 2026-03-31 9/450 2026-03-31 17:29 by 唐沐儿
[考研] 317求调剂 +12 蛋黄咸肉粽 2026-03-26 13/650 2026-03-31 16:44 by asdfzly
[考研] 286求调剂 +6 Faune 2026-03-30 6/300 2026-03-31 14:37 by jp9609
[考研] 354求调剂 +3 lxb598 2026-03-31 4/200 2026-03-31 13:42 by sophie2180
[考研] 求调剂 +4 图鉴212 2026-03-30 4/200 2026-03-31 10:20 by cal0306
[考研] 334分 一志愿武理 材料求调剂 +16 李李不服输 2026-03-26 16/800 2026-03-30 17:47 by wangjy2002
[考研] 283求调剂（080500） +14 A child 2026-03-27 14/700 2026-03-30 12:06 by 探123
[考研] 311求调剂 +10 lin0039 2026-03-26 10/500 2026-03-30 10:26 by herarysara
[考研] 一志愿中南大学化学0703总分337求调剂 +6 niko- 2026-03-27 6/300 2026-03-30 10:25 by herarysara
[考研] 337求调剂 +6 《树》 2026-03-29 6/300 2026-03-30 10:15 by herarysara
[考研] 299求调剂 +10 15188958825 2026-03-25 10/500 2026-03-29 17:51 by 王亮_大连医科大
[考研] 329求调剂 +10 钮恩雪 2026-03-25 10/500 2026-03-29 13:32 by peike
[考研] 298求调剂 +3 种圣赐 2026-03-29 3/150 2026-03-29 12:06 by longlotian
[考研] 086000生物与医药调剂 +5 Feisty。 2026-03-28 9/450 2026-03-29 12:02 by longlotian
[考研] 求调剂 +7 争取九点睡 2026-03-28 8/400 2026-03-28 21:07 by 争取九点睡
[考研] 本科新能源科学与工程，一志愿华理能动285求调剂 +7 AZMK 2026-03-28 11/550 2026-03-28 21:01 by xxxsssccc
[考研] 085701环境工程，267求调剂 +16 minht 2026-03-26 16/800 2026-03-28 12:16 by zllcz
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭